| 查看: 6769 | 回复: 18 | ||
| 当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖 | ||
[求助]
关于使用Dmol3进行过渡态搜索的问题！ 已有2人参与
|
||
|
本人新手 刚接触Dmol3不久 目前正在做吸附过渡态的搜索，有几个问题想请教大家： 1、对于吸附态轨迹文件的生成，我是把吸附前和吸附后的结构分别进行优化，然后分别做为反应物和生成物进行原子match，生成轨迹文件。但是我发现有一次有一种吸附结构居然不能生成轨迹文件 好像说反应物和生成物的晶体参数不一致。为什么会出现这种情况呢？还有我经常要手动进行一些原子match，正常吗？ 2、对于轨迹文件进行过渡态的搜索后，出现错误 Unable to bracket maximum from both endpoints Please check endpoints Cumulative number of energy/gradient calls : 17 这个问题我在论坛上搜索过，挺多的 但是回答的大部分是反应物和生成物的结构不对 需要调整。可是我的反应物和生成物都是优化过的，应该是稳定的还怎么进行调整呢？？ 3、关于反应物和生成物的优化，我好像看过有人说过渡态搜索时一些参数设置最好和优化时的一样，是这样吗？如果我对他们都用Castep进行优化，然后再到Dmol3进行TS搜索可以吗？如果想较容易的搜索出过渡态那么参数应该如何设置比较好呢？ 最后还是关于这个问题 Unable to bracket maximum from both endpoints Please check endpoints Cumulative number of energy/gradient calls : 17 是不是在参数设置上有什么问题呢？ 希望大家可以指点一下啊！~ 不胜感激~~ |
回复此楼» 猜你喜欢
filecode=后面第一个是大写字母
已经有8人回复
-
哪位老哥知道今年的国自然具体哪一天放榜？
已经有13人回复
-
今天系统多次维护，明天很可能放榜！
已经有9人回复
-
售SCI一区T0P文章，我:8O.55.1.O.5.4,科目齐全,可+急
已经有4人回复
-
售SCI一区T0P文章，我:8O.55.1.O.5.4,科目齐全,可+急
已经有4人回复
-
售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O.5.4,科目全,可+急
已经有3人回复
-
欢迎发来filecode的Mz6后的代码验证其规律
已经有74人回复
-
岩土工程学报什么时候才能终审完呐
已经有4人回复
-
时间戳又变了8-15
已经有25人回复
-
2027广东省杰青
已经有6人回复
» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
- 关于dmol3进行过渡态搜索中的energy of barrier
已经有12人回复
- 怀疑不存在过渡态的反应，DMOL3用LST/QST 过渡态搜索，得到的结构和产物一样
已经有10人回复
- 利用MS里的Dmol模块搜索过渡态不收敛
已经有5人回复
- 【求助】MS进行过渡态搜索失败，请教原因
已经有7人回复
- 【求助】dmol3 过渡态消虚频！！
已经有4人回复
- 【求助】关于Dmol3中消去过渡态的虚频！！急！！
已经有7人回复
- 【求助】dmol3计算过渡金属
已经有12人回复
- 【求助】DMOL3搜索过渡态计算失败——关于虚频
已经有20人回复
- 【求助】过渡态搜索失败原因？？
已经有6人回复
- 【求助】关于dmol中部分原子固定的几何优化问题
已经有10人回复
- 【求助】Dmol3和Castep的区别
已经有13人回复
- 【求助】DMol3过渡态搜索的相关问题
已经有6人回复
wangyoucheng
新虫 (初入文坛)
- 应助: 1 (幼儿园)
- 金币: 305.3
- 散金: 9
- 帖子: 45
- 在线: 76.5小时
- 虫号: 894806
- 注册: 2009-11-05
- 性别: MM
- 专业: 半导体材料
7楼2012-03-19 15:13:26
2楼2011-12-12 12:04:57
3楼2011-12-14 15:59:24
4楼2011-12-14 20:53:57
25