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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 量子化学 » Gaussian » homo和lumo批量提取的脚本
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秋雨子

金虫 (小有名气)

[求助] homo和lumo批量提取的脚本

最近在弄一批分子，一万个左右 ，想提取其中的homo和lumo能量值，但是发现很难实现，因为才接触脚本半年，还是自学的，所以搞不定了，有哪位大侠给个小脚本？我只会一点shell，提取个Energy还行，homo和lumo不好提取，若可以分享一下不胜感激！
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To the time to life, rather than to life in time
1楼 2011-12-05 22:47:40
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mchen10

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

引用回帖:
18楼: Originally posted by asaka at 2011-12-09 20:33:17:
以上作者只考虑闭壳层计算的情况，你有开壳层的计算吗？那时候你需要总的HOMO,LUMO还是分别alpha以及beta的HOMO和LUMO?
他们的程序都只有一点小问题，相信LZ可以搞定。
mchen10 的程序少了一个 |，多了一个奇怪 ...

CODE:
#!/bin/bash
# print homo lumo energy of gaussian output
# usage: print_homo_lumo filename(s)
for file in "$@"
do
echo $file
tac $file | tr "\n" "@" | egrep -o "@ Alpha virt\. eigenvalues.{0,75}@ Alpha  occ\. eigenvalues.{0,75}@ Alpha  occ\. eigenvalues" | tr "@" "\n" | head -n3 | awk '{if ($2 == "virt.") print $1" LUMO "$5; if($2 == "occ."){i=NF; print $1" HOMO "$i} }'
done

抱歉，tio2.rev是测试产物 去掉就好了（留着也不影响）
至于开壳闭壳的问题，我们给个思路 楼主如果什么都让别人来搞定 就算程序可以用 真正的收益也就那么一点点
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» 本帖已获得的红花（最新10朵）

秋雨子
更痛苦的是梦没醒路已经不能走了
19楼2011-12-11 04:06:32
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秋雨子

金虫 (小有名气)
没有人回复呢 ？！
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To the time to life, rather than to life in time
2楼2011-12-06 14:11:26
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秋雨子

金虫 (小有名气)
3楼2011-12-07 11:23:16
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abbott

金虫 (著名写手)

不要用QQ问我东西
★ ★
小红豆(金币+2): 感谢交流。 2011-12-14 18:07:53
你先贴一个样板文件,,,,
否则谁知道你要从什么文档中提取你要的东西啊.
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Chemistry[]==[]Chem[]is[]try!!!
4楼2011-12-08 10:57:14
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