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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 量子化学 » Gaussian » homo和lumo批量提取的脚本
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秋雨子

金虫 (小有名气)

[求助] homo和lumo批量提取的脚本

最近在弄一批分子，一万个左右 ，想提取其中的homo和lumo能量值，但是发现很难实现，因为才接触脚本半年，还是自学的，所以搞不定了，有哪位大侠给个小脚本？我只会一点shell，提取个Energy还行，homo和lumo不好提取，若可以分享一下不胜感激！
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To the time to life, rather than to life in time
1楼 2011-12-05 22:47:40
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mchen10

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
zhou2009(金币+5): 2011-12-11 20:12:00
秋雨子(金币+10): 非常感谢！谢谢交流！我试了下输出的只有文件名字，没有homo，lumo能量，还是我太笨，再仔细研究下！仍然感谢！ 2011-12-11 20:32:30
我来段bash吧 献拙了
CODE:
#!/bin/bash
# print homo lumo energy of gaussian output
# usage: print_homo_lumo filename(s)
for file in "$@"
do
echo $file
tac $file | tr "\n" "@" | egrep -o "@ Alpha virt\. eigenvalues.{0,75}@ Alpha  occ\. eigenvalues.{0,75}@ Alpha  occ\. eigenvalues" tio2.rev| tr "@" "\n" | head -n3 | awk '{if ($2 == "virt.") print $1" LUMO "$5; if($2 == "occ."){i=NF; print $1" HOMO "$i} }'
done
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更痛苦的是梦没醒路已经不能走了
15楼2011-12-10 02:54:54
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秋雨子

金虫 (小有名气)
没有人回复呢 ？！
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To the time to life, rather than to life in time
2楼2011-12-06 14:11:26
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秋雨子

金虫 (小有名气)
3楼2011-12-07 11:23:16
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abbott

金虫 (著名写手)

不要用QQ问我东西
★ ★
小红豆(金币+2): 感谢交流。 2011-12-14 18:07:53
你先贴一个样板文件,,,,
否则谁知道你要从什么文档中提取你要的东西啊.
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Chemistry[]==[]Chem[]is[]try!!!
4楼2011-12-08 10:57:14
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