24小时热门版块排行榜    

北京石油化工学院2026年研究生招生接收调剂公告
查看: 1487  |  回复: 2
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

shouling

金虫 (正式写手)

[求助] 如何将.cdx变成真正的mol2格式?

大家帮我看一下,我在进行分子对接的时候,用openbabel将.cdx转化成了mol2格式,并将所有的文件放入.mdb的文件夹中了,但是我在用MSS将这个数据库打开时,发现了下面的问题,里面显示的所有文件竟然是.cdx格式的了,请高手帮我解答,以下附上我的问题截图以及一张正确的图

这是错误的
我想现在的问题可能是我的openbabel的问题了,大家平时都是怎么转换格式的呢?




[ Last edited by shouling on 2011-12-5 at 14:27 ]
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)

» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:

已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

chf220284

铁杆木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★
shouling(金币+2): 也是,以前好用来着,现在不行了,我就采用你们的方法吧 2011-12-09 16:00:05
jiaoyixiong(金币+2): 鼓励交流 2011-12-11 22:52:19
我没有用过openbabel转换。说不定存在某种bug。
还是信赖chemoffice自己的转换吧。建议将cdx的在chem3d中存为mol2格式。毕竟经由同一个软件转换出错的概率低一些。把已经转换的mol2格式的文件试着用chem3d打开,看看是不是有什么不妥,再次保存为mol2也许就可以了。
3楼2011-12-09 15:14:11
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 3 个回答

chf220284

铁杆木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★
shouling(金币+2): 那个我知道,但是现在就是出现了这个情况,把整理好的mol2文件放到数据库文件中,它不显示啊 2011-12-08 17:11:33
jiaoyixiong(金币+2): 鼓励交流 2011-12-11 22:52:05
ChemOffice里除了ChemDraw还有Chem3D在那里可以存为mol2格式。
2楼2011-12-07 11:56:29
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[论文投稿] Journal of Mechanical Science and Technology +3 Russ_ss 2026-03-25 5/250 2026-03-27 10:49 by 陆小果画大饼
[考研] 0703化学一志愿南京师范大学303求调剂 +3 zzffylgg 2026-03-24 3/150 2026-03-27 10:42 by shangxh
[考研] 一志愿吉大071010,316分求调剂 +3 xgbiknn 2026-03-27 3/150 2026-03-27 10:36 by guoweigw
[考研] 食品工程专硕求调剂 +3 小张zxy张 2026-03-26 3/150 2026-03-27 01:14 by dgnhs
[考研] 求调剂 一志愿 本科 北科大 化学 343 +6 13831862839 2026-03-24 7/350 2026-03-26 22:57 by 不吃魚的貓
[考研] 生物学 296 求调剂 +4 朵朵- 2026-03-26 6/300 2026-03-26 19:01 by 不吃魚的貓
[考研] 22 350 本科985求调剂,求老登收留 +4 李轶男003 2026-03-20 4/200 2026-03-26 16:05 by 哇啦啦啦xtj
[考研] 资源与环境 调剂申请(333分) +9 holy J 2026-03-21 9/450 2026-03-26 15:47 by 161765490
[考研] 调剂310 +3 温柔的晚安 2026-03-25 4/200 2026-03-25 23:16 by peike
[考研] 303求调剂 +6 蓝山月 2026-03-25 6/300 2026-03-25 22:47 by 418490947
[考研] 网络空间安全0839招调剂 +4 w320357296 2026-03-25 6/300 2026-03-25 17:59 by 255671
[考研] 296求调剂 +4 汪!?! 2026-03-25 7/350 2026-03-25 16:41 by 汪!?!
[考研] 086003食品工程求调剂 +6 淼淼111 2026-03-24 6/300 2026-03-25 10:29 by 3Strings
[考研] 上海电力大学材料防护与新材料重点实验室招收调剂研究生(材料、化学、电化学,环境) +4 我爱学电池 2026-03-23 4/200 2026-03-25 00:59 by 1027_324
[考研] 求调剂 +6 研研,接电话 2026-03-24 7/350 2026-03-24 17:01 by barlinike
[考研] 085404电子信息284分求调剂 +4 13659058978 2026-03-24 4/200 2026-03-24 12:15 by syl20081243
[考研] 一志愿重庆大学085700资源与环境,总分308求调剂 +7 墨墨漠 2026-03-23 8/400 2026-03-23 20:36 by Creta
[考研] 306求调剂 +5 来好运来来来 2026-03-22 5/250 2026-03-22 16:17 by BruceLiu320
[考研] 求调剂 +4 要好好无聊 2026-03-21 4/200 2026-03-21 18:57 by 学员8dgXkO
[考研] 一志愿南大,0703化学,分数336,求调剂 +3 收到VS 2026-03-21 3/150 2026-03-21 18:42 by 学员8dgXkO
信息提示
请填处理意见