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shouling

金虫 (正式写手)

[求助] 如何将.cdx变成真正的mol2格式？

大家帮我看一下，我在进行分子对接的时候，用openbabel将.cdx转化成了mol2格式，并将所有的文件放入.mdb的文件夹中了，但是我在用MSS将这个数据库打开时，发现了下面的问题，里面显示的所有文件竟然是.cdx格式的了，请高手帮我解答，以下附上我的问题截图以及一张正确的图

这是错误的
我想现在的问题可能是我的openbabel的问题了，大家平时都是怎么转换格式的呢？




[ Last edited by shouling on 2011-12-5 at 14:27 ]
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1楼 2011-12-05 14:23:38
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chf220284

铁杆木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★
shouling(金币+2): 那个我知道，但是现在就是出现了这个情况，把整理好的mol2文件放到数据库文件中，它不显示啊 2011-12-08 17:11:33
jiaoyixiong(金币+2): 鼓励交流 2011-12-11 22:52:05
ChemOffice里除了ChemDraw还有Chem3D在那里可以存为mol2格式。
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2楼2011-12-07 11:56:29
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chf220284

铁杆木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★
shouling(金币+2): 也是，以前好用来着，现在不行了，我就采用你们的方法吧 2011-12-09 16:00:05
jiaoyixiong(金币+2): 鼓励交流 2011-12-11 22:52:19
我没有用过openbabel转换。说不定存在某种bug。
还是信赖chemoffice自己的转换吧。建议将cdx的在chem3d中存为mol2格式。毕竟经由同一个软件转换出错的概率低一些。把已经转换的mol2格式的文件试着用chem3d打开，看看是不是有什么不妥，再次保存为mol2也许就可以了。
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3楼2011-12-09 15:14:11
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