| 查看: 3314 | 回复: 13 | ||
| 当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖 | ||
heapyssb木虫 (著名写手)
|
[求助]
PSI-BLAST怎样输出蛋白序列的PSSM打分矩阵
|
|
|
最近在研究PSSM方面的问题，新手入门，很多东西都不明白，还希望精通这方面的学者给予帮助啊。先谢谢大家了。 我在网上也找了很多相关的资料，但基本上啊是没找到我想要的。 很多人用blastpgp能得到这个pssm的打分举证，但是我在ncbi上下载本地版的blast安装后，在bin文件夹里面没有找到这个blastpgp课执行文件啊（blast版本为blast-2.2.25+） 很多文献报道PSI-BLAST得到profile（我不知道这个单词怎么翻译跟准确），那个这个profile和pssm有联系吗？ 可能是我对pssm具体是指什么还不是很明白，希望能有人帮下我，具体的说明下跟怎样使用现在这个版本的blast得到被测序列的pssm值。 |
回复此楼» 猜你喜欢
药学硕士，第一、第二作者已发表6 篇 SCI，药理方向及相关方向2026年/2027年博士申请
已经有4人回复
-
26年博士申请自荐-电催化
已经有3人回复
-
中国地质大学（北京）博士招生补录，数理学院材料科学与工程专业和材料与化工专业
已经有6人回复
-
收到国自然专家邀请后几年才会有本子送过来评
已经有4人回复
-
考博
已经有5人回复
-
26年申博自荐-计算机视觉
已经有4人回复
-
药化及相关博士的申请
已经有3人回复
-
一篇MDPI论文改变了学习工作和生活
已经有4人回复
13楼2016-03-18 10:19:34
heapyssb(金币+2): 2011-12-02 18:53:57
|
本帖内容被屏蔽 |
2楼2011-12-02 17:36:30
heapyssb
木虫 (著名写手)
- 应助: 0 (幼儿园)
- 金币: 4135.8
- 散金: 3994
- 红花: 28
- 帖子: 1190
- 在线: 225.9小时
- 虫号: 972530
- 注册: 2010-03-16
- 专业: 生物信息学
3楼2011-12-02 18:52:36
★
amisking(金币+1): 鼓励发帖交流。 2011-12-02 19:47:22
heapyssb(金币+2): 2011-12-02 20:19:52
amisking(金币+1): 鼓励发帖交流。 2011-12-02 19:47:22
heapyssb(金币+2): 2011-12-02 20:19:52
|
本帖内容被屏蔽 |
4楼2011-12-02 19:11:07