24小时热门版块排行榜    

Znn3bq.jpeg
查看: 1202  |  回复: 1

hoowenhao

铁虫 (小有名气)

[求助] 高斯计算mulinkin电荷

Sample Text背景介绍:小弟是做分子动力学模拟的,对于量化软件所知甚少,在模拟过程编写FIELD文件过程中需要一些有机物如苯酚,CV等物质的mulinkin电荷数据,从而需要用到量化计算。
Sample Text1 先进chemoffice软件画出结构图,将2D3D,在3D将分子优化(优化步骤:按住CTRL+A选中分子,点击Structure-clean up,然后选择CalculationsMM2---Minimize Energy-Run就OK.)保存到F盘 文件名要改为英文格式
            保存类型  Protein Date Bank (*.pdb)

2点击Gaussview-File-open选择要打开的文件
           文件类型: Brookhaven PDB File(*.pdb*.ent)
            Open as:  Auto
3保存save , 文件名后缀删除(pdb)----YES
Gaussian input files (*.gjf*.com)
4 回F盘--Gaussia点击GJF文件(1将文件里后面的数字删除;2文件前面的基组改为%chk=xxx.chk  (xxx为前面chemoffice里面系统默认的文件名,此行一般不需要改。)
%mem=60MW
%nproc=1
# b3lyp/6-311+g(d,p) opt freq
5  点击Gaussia   File-open-F---gif(文件)-“运行”就可以了
6 运行计算完毕后,回F盘点击OUT文件,按鼠标右键选择打开方式“记事本”打开
就可以看到输出结构
7在输出结构里面找优化以后的数值即可
  在文件里输入单词“stationary”就可以找到优化完的地方。上面显示“Optimization completed.”
   下面就是想要的数值
Alpha  occ. eigenvalues --  最后一个数值就是最高占有轨道能
Alpha virt. eigenvalues -    里面第一个数值就是最低未占有轨道能
Mulliken atomic charges:----就是原子电荷
Dipole moment-----偶极矩
Frequencies—这个单词的一个数值是正数就说明没虚频。分子结构稳定


这个是从以前毕业了的师姐(师姐也是从别人那得到的)那儿得到的一个计算过程,但是这两天在做的时候老是会运行终止,但是师姐说以前这样算是没有问题的。求虫友帮助指导!
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)

» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:

少壮不努力,长大水处理。
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

阿泰斯特

新虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

hoowenhao(金币+1): 2011-11-30 16:27:47
你要看看最后几行到底是什么样的
2楼2011-11-25 22:05:21
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 hoowenhao 的主题更新
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 一志愿0703化学招61最终排名62化学求调剂 +20 招61排名62 2026-04-07 24/1200 2026-04-10 13:26 by moonboat
[考研] 314求调剂 +22 wakeluofu 2026-04-09 23/1150 2026-04-10 12:08 by pengliang8036
[考研] 288求调剂 +12 代fish 2026-04-09 12/600 2026-04-10 11:57 by jxlabyan
[考研] 083200 305分 求二轮调剂 不接受跨专业 +8 Claireyyyy 2026-04-09 8/400 2026-04-10 10:05 by luosha500
[考研] 273求调剂 +46 麦小叮当 2026-04-06 53/2650 2026-04-10 10:02 by cyh—315
[考研] 296求调剂 +5 汪!?! 2026-04-09 5/250 2026-04-09 17:47 by 柠檬不酸zy
[考研] 291求调剂 +7 关忆北. 2026-04-09 8/400 2026-04-09 15:17 by 探123
[硕博家园] 有没有学校材料专业收跨调(一志愿085410) +5 momo(上岸版) 2026-04-06 8/400 2026-04-09 15:07 by only周
[考研] 368化学求调剂 +13 wwwwabcde 2026-04-07 14/700 2026-04-09 14:47 by heaven_jay
[考研] 材料专硕322 +14 哈哈哈吼吼吼哈 2026-04-05 14/700 2026-04-09 13:25 by 5268321
[考研] 285求调剂 +20 哦呦呼o 2026-04-04 20/1000 2026-04-08 22:23 by yutian743
[考研] 338求调剂 +8 wxygxsaaaaa 2026-04-06 8/400 2026-04-08 06:58 by 无际的草原
[考研] 一志愿南科大生物学297分,求调剂推荐 +8 Y-yyusx 2026-04-06 9/450 2026-04-07 19:38 by biomichael
[考研] 318求调剂 +5 李青山山山 2026-04-07 5/250 2026-04-07 18:24 by 蓝云思雨
[考研] 307求调剂 +3 Youth@@ 2026-04-07 3/150 2026-04-07 09:25 by 小黑不怕难
[考研] 一志愿河北工业大学材料工程,初试344求专硕调剂 +6 15933906766 2026-04-05 6/300 2026-04-06 13:21 by 无际的草原
[考研] 第一志愿东南大学物理313,有科研竞赛获奖经历,希望物理复试调剂 +3 马内橙 2026-04-05 3/150 2026-04-06 10:32 by 蓝云思雨
[考研] 295求调剂 +8 FZAC123 2026-04-03 8/400 2026-04-05 17:46 by 蓝云思雨
[考研] 22408求调剂 354分 可跨专业 +3 hannnnnnn 2026-04-04 3/150 2026-04-04 14:35 by 土木硕士招生
[考研] 317分 一志愿江南大学 化学工程学硕 求调剂 +6 YinTai 2026-04-03 6/300 2026-04-03 22:30 by 无际的草原
信息提示
请填处理意见