24小时热门版块排行榜    

查看: 2971  |  回复: 4
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

超人与小木虫

金虫 (小有名气)

[求助] 磷脂双分子层模型怎么建立?

急!!本人想做跨膜蛋白的动力学模拟,蛋白同源建模后想将其嵌入磷脂双分子层模型中,然后跑分子动力学,请问生物膜模型怎么建立?哪里能下载吗?如何嵌入其中??希望有经验的大侠能指导一下,本人不胜感激!!
回复此楼
超人不会飞
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

SunnyRain0.0

金虫 (正式写手)

引用回帖:
3楼: Originally posted by 超人与小木虫 at 2011-12-03 11:43:26
我想用AMBER跑动力学,就在构建脂膜-蛋白-水体系这里遇到麻烦了,不知道怎么将蛋白嵌入到生物膜里,看过VMD的那个教程,但还要结合NAMD,我手头上已经有DMPC、popc的磷脂双分子层的模型了。希望大侠能指导我一下! ...

能不能把你的双分子层模型给我一份啊?
Ihaveonedream~
5楼2013-07-23 18:07:31
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 5 个回答

夏天的鱼

木虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★
chaizhm(金币+1): 谢谢 2011-12-01 17:48:48
超人与小木虫(金币+5): 有帮助 2012-03-08 13:30:25
引用回帖:
1楼: Originally posted by 超人与小木虫 at 2011-11-19 15:33:52:
急!!本人想做跨膜蛋白的动力学模拟,蛋白同源建模后想将其嵌入磷脂双分子层模型中,然后跑分子动力学,请问生物膜模型怎么建立?哪里能下载吗?如何嵌入其中??希望有经验的大侠能指导一下,本人不胜感激!!

这个看你要用什么软件进行动力学模拟啊,还有具体要的是什么磷脂层
科研就是讨论出来的
2楼2011-12-01 17:08:50
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

超人与小木虫

金虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by 夏天的鱼 at 2011-12-01 17:08:50:
这个看你要用什么软件进行动力学模拟啊,还有具体要的是什么磷脂层

我想用AMBER跑动力学,就在构建脂膜-蛋白-水体系这里遇到麻烦了,不知道怎么将蛋白嵌入到生物膜里,看过VMD的那个教程,但还要结合NAMD,我手头上已经有DMPC、popc的磷脂双分子层的模型了。希望大侠能指导我一下!谢谢!
超人不会飞
3楼2011-12-03 11:43:26
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

夏天的鱼

木虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★
chaizhm(金币+1): 2011-12-05 09:52:46
超人与小木虫(金币+5): 有帮助 2012-03-08 13:30:40
引用回帖:
3楼: Originally posted by 超人与小木虫 at 2011-12-03 11:43:26:
我想用AMBER跑动力学,就在构建脂膜-蛋白-水体系这里遇到麻烦了,不知道怎么将蛋白嵌入到生物膜里,看过VMD的那个教程,但还要结合NAMD,我手头上已经有DMPC、popc的磷脂双分子层的模型了。希望大侠能指导我一下 ...

你要是已经有了膜就可以手动放进去,保证关键区域方位跟文献报道的一致就可以了
科研就是讨论出来的
4楼2011-12-04 08:43:37
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 284求调剂 +8 天下熯 2026-02-28 8/400 2026-03-02 00:15 by 暮雨星晴
[基金申请] 本子写完了,给DS兄弟看了,得了92分 +3 Doma 2026-03-01 7/350 2026-03-02 00:00 by jnzsy
[考研] 材料学硕318求调剂 +11 February_Feb 2026-03-01 13/650 2026-03-01 23:53 by ccp273206157
[考研] 0856材料与化工,270求调剂 +6 YXCT 2026-03-01 6/300 2026-03-01 23:21 by 向上的胖东
[考研] 江苏省农科院招调剂1名 +3 Qwertyuop 2026-03-01 3/150 2026-03-01 23:18 by aaadim
[基金申请] 成果系统访问量大,请一小时后再尝试。---NSFC啥时候好哦,已经两天这样了 +4 NSFC2026我来了 2026-02-28 4/200 2026-03-01 22:37 by 铁门栓
[考研] 0856调剂 +5 刘梦微 2026-02-28 5/250 2026-03-01 22:30 by wang_dand
[考研] 26考研报考西工大材料308分求调剂 +3 weizhong123 2026-03-01 3/150 2026-03-01 21:42 by 公瑾逍遥
[考研] 298求调剂 +6 axyz3 2026-02-28 6/300 2026-03-01 19:00 by 18137688336
[考研] 272求调剂 +6 材紫有化 2026-02-28 6/300 2026-03-01 18:58 by 18137688336
[考研] 291分工科求调剂 +9 science饿饿 2026-03-01 10/500 2026-03-01 18:55 by 18137688336
[考研] 化工专硕342,一志愿大连理工大学,求调剂 +3 kyf化工 2026-02-28 4/200 2026-03-01 16:49 by yywzz
[考研] 求调剂 +6 repeatt?t 2026-02-28 6/300 2026-03-01 14:37 by Sakura绘
[考研] 295复试调剂 +3 简木ChuFront 2026-03-01 3/150 2026-03-01 14:27 by zzxw520th
[考研] 材料284求调剂,一志愿郑州大学英一数二专硕 +10 想上岸的土拨鼠 2026-02-28 10/500 2026-03-01 14:12 by yc258
[考研] 调剂 +3 简木ChuFront 2026-02-28 3/150 2026-03-01 11:46 by 王伟要上岸啊
[考研] 311求调剂 +9 南迦720 2026-02-28 10/500 2026-03-01 10:55 by sunny81
[考博] 博士自荐 +4 kkluvs 2026-02-28 4/200 2026-03-01 10:19 by 馥安馥安
[考研] 304求调剂 +3 52hz~~ 2026-02-28 5/250 2026-03-01 00:00 by 52hz~~
[考研] 276求调剂 +3 路lyh123 2026-02-28 4/200 2026-02-28 19:45 by 路lyh123
信息提示
请填处理意见