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zhugezilong木虫 (著名写手)
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分子对称性的选择问题
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我最近想分析一下一个多酸化合物Mo6O19的分子轨道并计算其吸收光谱。这个分子是个-2价的分子，Mo是正6价，O为-2价，是正六面体结构，分子对称性为Oh。在这个分子中其中有个氧分子是位于正六面体的体心位置的，和6个钼都有共价键作用。 我用晶体cif文件选取分子坐标，然后用gaussview将其处理成Oh对称性，并在优化过程中让其保持对称性不变，用rb3lyp/3-21G进行优化，电荷为-2，S为1，结果优化后的得到的Oh构型中存在三个一样的虚频。 1 2 3 T1G T1G T1G Frequencies -- -160.3709 -160.3709 -160.3709 Red. masses -- 22.9099 22.9099 22.9099 Frc consts -- 0.3472 0.3472 0.3472 IR Inten -- 0.0000 0.0000 0.0000 如果把虚频坐标加到优化后的结构中后再进行优化的话，虚频消除了，但是分子的对称性就从Oh变为了C1。如果限定为Oh对称性的话，总是会出现三个一样的虚频。 我想研究这个分子的吸收光谱和激发态。我想问下，我应该采用没有虚频的C1对称性结构去计算TD-DFT，还是应该采用带有虚频的Oh对称性结构呢？ 有办法在保持高对称性的同时来消除虚频吗？ 非常感谢。  Mo6O19结构 [ Last edited by zhugezilong on 2011-11-18 at 22:09 ] |
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