应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 量子化学 » Gaussian » 分子对称性的选择问题
北京石油化工学院2026年研究生招生接收调剂公告
51/1返回列表
查看: 1661  |  回复: 4
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看
当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖

zhugezilong

木虫 (著名写手)

[求助] 分子对称性的选择问题

我最近想分析一下一个多酸化合物Mo6O19的分子轨道并计算其吸收光谱。这个分子是个-2价的分子，Mo是正6价，O为-2价，是正六面体结构，分子对称性为Oh。在这个分子中其中有个氧分子是位于正六面体的体心位置的，和6个钼都有共价键作用。
我用晶体cif文件选取分子坐标，然后用gaussview将其处理成Oh对称性，并在优化过程中让其保持对称性不变，用rb3lyp/3-21G进行优化，电荷为-2，S为1，结果优化后的得到的Oh构型中存在三个一样的虚频。
                   1                      2                      3
                    T1G                    T1G                    T1G
Frequencies --  -160.3709              -160.3709              -160.3709
Red. masses --    22.9099                22.9099                22.9099
Frc consts  --     0.3472                 0.3472                 0.3472
IR Inten    --     0.0000                 0.0000                 0.0000
如果把虚频坐标加到优化后的结构中后再进行优化的话，虚频消除了，但是分子的对称性就从Oh变为了C1。如果限定为Oh对称性的话，总是会出现三个一样的虚频。
我想研究这个分子的吸收光谱和激发态。我想问下，我应该采用没有虚频的C1对称性结构去计算TD-DFT，还是应该采用带有虚频的Oh对称性结构呢？
有办法在保持高对称性的同时来消除虚频吗？
非常感谢。

Mo6O19结构

[ Last edited by zhugezilong on 2011-11-18 at 22:09 ]
回复此楼

» 收录本帖的淘帖专辑推荐

对称性相关

» 猜你喜欢

» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
1楼 2011-11-18 21:31:17
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

zhugezilong

木虫 (著名写手)
引用回帖:
2楼: Originally posted by beefly at 2011-11-18 22:21:43:
这里有三个简并的虚频模式，可能结果造成三个模式的简正坐标混在一起，降低对称性后，每个模式对应的都不是简正坐标。导致从Oh一下降到C1对称性。
遇到这种问题，要么根据振动动画猜出“干净的”简正坐标。或者用 ...

非常感谢。如何去根据振动动画猜出干净的简正坐标呢？是不是不是很容易呀。另外，如果用ADF进行优化的结果，然后再用gaussian去计算TD-DFT可行吗，还是必须都在ADF中进行计算了。那得重新学ADF了。
赞一下 回复此楼
3楼2011-11-20 13:24:01
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 5 个回答

beefly

专家顾问 (职业作家)

地沟油冶炼专家
★ ★ ★
gmy1990(金币+3): 2011-11-18 22:33:06
这里有三个简并的虚频模式，可能结果造成三个模式的简正坐标混在一起，降低对称性后，每个模式对应的都不是简正坐标。导致从Oh一下降到C1对称性。
遇到这种问题，要么根据振动动画猜出“干净的”简正坐标。或者用处理对称性比较好的其它程序帮助分析，比如ADF。
赞一下(1人) 回复此楼
beefly《西太平洋大学现代英汉词典》[bi:fli]牛肉一般地
2楼2011-11-18 22:21:43
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

beefly

专家顾问 (职业作家)

地沟油冶炼专家
先用adf做opt+freq计算，如果体系对基组的依赖性不强，可以用小一些的基组。得到定性正确的虚频模式以后，乘上个小的位移因子，加到gaussian优化的结构上（可能需要调整原子顺序）
赞一下 回复此楼
beefly《西太平洋大学现代英汉词典》[bi:fli]牛肉一般地
4楼2011-11-20 23:07:56
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

zhugezilong

木虫 (著名写手)
非常感谢。我试试看
赞一下 回复此楼
5楼2011-11-21 13:49:37
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 5 个回答
普通表情 龙 兔 虎 猫
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 086502化学工程342求调剂 +6 阿姨复古不过 2026-03-27 6/300 2026-03-28 07:06 by wangy0907
[考研] 315分求调剂 +7 26考研上岸版26 2026-03-26 7/350 2026-03-28 04:05 by fmesaito
[考研] 275求调剂 +10 Micky11223 2026-03-25 13/650 2026-03-27 22:42 by Micky11223
[考研] 277跪求调剂 +5 1915668 2026-03-27 8/400 2026-03-27 19:53 by WYUMater
[考研] 一志愿上海理工能源动力（085800）310分求调剂 +3 zhangmingc 2026-03-27 4/200 2026-03-27 19:01 by 给你你注意休息
[考研] 一志愿北京化工大学 070300 学硕 336分 求调剂 +9 vv迷 2026-03-22 9/450 2026-03-27 15:59 by 不吃魚的貓
[考研] 085600，材料与化工321分，求调剂 +9 大馋小子 2026-03-27 9/450 2026-03-27 14:30 by mmm just
[考研] 求调剂 +3 刘柯@ 2026-03-24 4/200 2026-03-27 11:28 by shangxh
[考研] 一志愿郑大085600，310分求调剂 +5 李潇可 2026-03-26 5/250 2026-03-27 11:14 by 不吃魚的貓
[考研] 求调剂，一志愿 南京航空航天大学大学 ，080500材料科学与工程学硕 +4 @taotao 2026-03-26 5/250 2026-03-27 08:10 by hypershenger
[考研] 求调剂 一志愿 本科 北科大 化学 343 +6 13831862839 2026-03-24 7/350 2026-03-26 22:57 by 不吃魚的貓
[考研] 263求调剂 +6 yqdszhdap－ 2026-03-22 10/500 2026-03-26 13:11 by 公瑾逍遥
[考研] 材料专硕 335 分求调剂 +4 拒绝冷暴力 2026-03-25 4/200 2026-03-25 18:45 by haxia
[考研] 生物技术与工程 +3 1294608413 2026-03-25 4/200 2026-03-25 18:02 by 1294608413
[考研] 0854电子信息求调剂 +7 α____ 2026-03-22 9/450 2026-03-25 13:37 by α____
[有机交流] 有机合成求助 20+3 FENGSHUJEI 2026-03-23 5/250 2026-03-24 19:31 by 88817753
[考研] 求老师收我 +3 zzh16938784 2026-03-23 3/150 2026-03-23 12:56 by ztnimte
[考研] 276求调剂 +3 YNRYG 2026-03-21 4/200 2026-03-23 08:31 by 醉在风里
[考研] 一志愿东华大学控制学硕320求调剂 +3 Grand777 2026-03-21 3/150 2026-03-21 19:23 by 简之-
[考研] 一志愿南大，0703化学，分数336，求调剂 +3 收到VS 2026-03-21 3/150 2026-03-21 18:42 by 学员8dgXkO
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭