24小时热门版块排行榜    

查看: 3169  |  回复: 14
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

daidai~

铁虫 (小有名气)

[求助] 求助:vasp优化出错!!!

在用vasp进行优化晶体时,出现了这样的错误信息,但不知道根本原因在什么地方,麻烦各位大侠指导一下啊!!
以下是 out 文件的内容:
running /opt/vasp/bin/vasp-intel.mpich on 16 LINUX ch_p4 processors
Created /home/liaoy271/vasp-lihaijiao/cif-NDI-CycloHexane-opt/PI11309
running on   16 nodes
distr:  one band on    4 nodes,    4 groups
vasp.4.6.36 17Feb09 complex
POSCAR found :  4 types and  116 ions
LDA part: xc-table for Pade appr. of Perdew

-----------------------------------------------------------------------------
|                                                                             |
|           W    W    AA    RRRRR   N    N  II  N    N   GGGG   !!!           |
|           W    W   A  A   R    R  NN   N  II  NN   N  G    G  !!!           |
|           W    W  A    A  R    R  N N  N  II  N N  N  G       !!!           |
|           W WW W  AAAAAA  RRRRR   N  N N  II  N  N N  G  GGG   !            |
|           WW  WW  A    A  R   R   N   NN  II  N   NN  G    G                |
|           W    W  A    A  R    R  N    N  II  N    N   GGGG   !!!           |
|                                                                             |
|      The distance between some ions is very small                           |
|      please check the nearest neigbor list in the OUTCAR file               |
|          I HOPE YOU KNOW, WHAT YOU ARE  DOING                               |
|                                                                             |
-----------------------------------------------------------------------------

POSCAR, INCAR and KPOINTS ok, starting setup
FFT: planning ...           4
reading WAVECAR
entering main loop
       N       E                     dE             d eps       ncg     rms          rms(c)
DAV:   1     0.466579028730E+05    0.46658E+05   -0.23023E+05  5376   0.110E+03
DAV:   2     0.432967695633E+05   -0.33611E+04   -0.32721E+04  4528   0.451E+02
DAV:   3     0.430265038097E+05   -0.27027E+03   -0.26324E+03  4144   0.118E+02
DAV:   4     0.430181592116E+05   -0.83446E+01   -0.82865E+01  4376   0.188E+01
DAV:   5     0.430179938704E+05   -0.16534E+00   -0.16513E+00  4352   0.231E+00    0.223E+02
RMM:   6     0.440645298423E+05    0.10465E+04   -0.85207E+02  3872   0.528E+01    0.153E+02
RMM:   7     0.444508147350E+05    0.38628E+03   -0.17935E+03  4055   0.756E+01    0.580E+01
RMM:   8     0.445692884840E+05    0.11847E+03   -0.53496E+02  4160   0.270E+01    0.351E+01
RMM:   9     0.446637434712E+05    0.94455E+02   -0.64548E+01  3964   0.103E+01    0.256E+01
RMM:  10     0.446804700179E+05    0.16727E+02   -0.94208E+01  3977   0.124E+01    0.182E+01
RMM:  11     0.446946931090E+05    0.14223E+02   -0.16312E+01  3866   0.632E+00    0.101E+01
RMM:  12     0.446976549501E+05    0.29618E+01   -0.26086E+00  3941   0.218E+00    0.770E+00
RMM:  13     0.446986528602E+05    0.99791E+00   -0.15190E+00  3907   0.157E+00    0.631E+00
RMM:  14     0.446992856487E+05    0.63279E+00   -0.19948E+00  3930   0.204E+00    0.386E+00
RMM:  15     0.446993507132E+05    0.65064E-01   -0.80142E-01  3860   0.132E+00    0.265E+00
RMM:  16     0.446995118171E+05    0.16110E+00   -0.32102E-01  4000   0.738E-01    0.174E+00
RMM:  17     0.446994310176E+05   -0.80799E-01   -0.26387E-01  3984   0.625E-01    0.150E+00
RMM:  18     0.446994972974E+05    0.66280E-01   -0.53282E-02  3811   0.375E-01    0.772E-01
RMM:  19     0.446995019712E+05    0.46738E-02   -0.60477E-02  3984   0.318E-01    0.362E-01
RMM:  20     0.446995023925E+05    0.42129E-03   -0.70397E-03  3902   0.138E-01    0.225E-01
RMM:  21     0.446995008464E+05   -0.15461E-02   -0.92409E-03  3952   0.112E-01    0.234E-01
RMM:  22     0.446995026384E+05    0.17920E-02   -0.15420E-03  3288   0.619E-02    0.105E-01
RMM:  23     0.446995020558E+05   -0.58259E-03   -0.17440E-03  3338   0.531E-02    0.564E-02
RMM:  24     0.446995022038E+05    0.14797E-03   -0.17716E-04  2521   0.238E-02    0.339E-02
RMM:  25     0.446995021915E+05   -0.12355E-04   -0.81477E-05  2211   0.181E-02
   1 F= 0.44699502E+05 E0= 0.44699502E+05  d E =0.446995E+05
damped:  g(F)=  0.530E+08 g(S)=  0.000E+00 dE (1.order)=-0.884E+08
REAL_OPTLAY: internal error (1)     2640089     2643153
REAL_OPTLAY: internal error (1)     2640089     2643153
REAL_OPTLAY: internal error (1)     2640089     2643153
REAL_OPTLAY: internal error (1)     2640089     2643153
REAL_OPTLAY: internal error (1)     2640089     2643153
REAL_OPTLAY: internal error (1)     2640089     2643153
REAL_OPTLAY: internal error (1)     2640089     2643153
REAL_OPTLAY: internal error (1)     2640089     2643153
REAL_OPTLAY: internal error (1)     2640089     2643153
REAL_OPTLAY: internal error (1)     2640089     2643153
REAL_OPTLAY: internal error (1)     2640089     2643153
bond charge predicted
REAL_OPTLAY: internal error (1)     2640089     2643153
REAL_OPTLAY: internal error (1)     2640089     2643153
REAL_OPTLAY: internal error (1)     2640089     2643153
REAL_OPTLAY: internal error (1)     2640089     2643153
REAL_OPTLAY: internal error (1)     2640089     2643153

问题到底出在了什么地方啊???求原因
回复此楼

» 收录本帖的淘帖专辑推荐

vasp编译问题集锦

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:

已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

daidai~

铁虫 (小有名气)

引用回帖:
4楼: Originally posted by zyuea at 2011-11-18 18:31:19:
如果能正常算就不用管他,如果不能算就检查一下POSCAR,坐标有没有弄错

POSCAR我用的就是Direct的坐标,内容如下:
NDI-CycloHexane-opt
1.000000
       7.004989011320049      -0.558120998550918      -1.000116944292960
       0.000000000000000      10.221302179506349      -1.133859671749008
       0.000000000000000       0.000000000000000      14.523999999999999
52 52 4 8
Direct
  0.2563886962702822   0.2854916001828322   0.0995680316397339
-0.3180590285580115  -0.1296816588863387  -0.1873545185157640
-0.0716632102047225   0.4322348737932086  -0.1696211717633248
-0.3867243753876360   0.4070089047739701  -0.1450205602747418
-0.4381163189607438   0.3084223543357202  -0.2372252743539481
-0.5221992488623007   0.5153501521893991  -0.2715454119173071
-0.3159176975757987   0.5776837036486345  -0.2304421913903733
-0.3450397989338930   0.5492867683861356  -0.3924033347886838
-0.4081376852097643   0.3997738953239531  -0.3954074577841470
-0.2448255089663329  -0.2915129799712987  -0.0919436072496013
  0.3294794604631465   0.1236524841237743   0.1949685042870578
  0.0830836421098576  -0.4382640485557730   0.1771663059785734
-0.0389722238762734  -0.3181347307220129   0.2966333707791338
  0.1658817734220868  -0.2530419171210905   0.3382668099189709
  0.1007853115628169  -0.4275139825170826   0.4217885041272987
  0.0523912313648071  -0.5240779755416715   0.3286399391973114
  0.3564602308390281  -0.5553159431486999   0.4000173205599776
  0.4195581171148994  -0.4058030700865175   0.4030214435554407
  0.3981448072927711  -0.4129402446440287   0.1525733322646462
  0.4495367508658790  -0.3145493639907902   0.2448316223505860
  0.5336196807674358  -0.5213793269519632   0.2791593976886009
  0.3273381294809337  -0.5836150435186932   0.2379949633802778
  0.0503926557814085   0.3123012257444598  -0.2890729610145734
-0.1544613415169517   0.2470127423585262  -0.3306528241476772
-0.0893648796576819   0.4214848077545182  -0.4141745183560049
-0.0408280440608579   0.5180565957532047  -0.3210155148071788
-0.2563886962702822  -0.2854916001828322  -0.0995680316397339
  0.3180590285580115   0.1296816588863387   0.1873545185157640
  0.0716632102047225  -0.4322348737932086   0.1696211717633248
  0.3867243753876360  -0.4070089047739701   0.1450205602747418
  0.4381163189607438  -0.3084223543357202   0.2372252743539481
  0.5221992488623007  -0.5153501521893991   0.2715454119173071
  0.3159176975757987  -0.5776837036486345   0.2304421913903733
  0.3450397989338930  -0.5492867683861356   0.3924033347886838
  0.4081376852097643  -0.3997738953239531   0.3954074577841470
  0.2448255089663329   0.2915129799712987   0.0919436072496013
-0.3294794604631465  -0.1236524841237743  -0.1949685042870578
-0.0830836421098576   0.4382640485557730  -0.1771663059785734
  0.0389722238762734   0.3181347307220129  -0.2966333707791338
-0.1658817734220868   0.2530419171210905  -0.3382668099189709
-0.1007853115628169   0.4275139825170826  -0.4217885041272987
-0.0523912313648071   0.5240779755416715  -0.3286399391973114
-0.3564602308390281   0.5553159431486999  -0.4000173205599776
-0.4195581171148994   0.4058030700865175  -0.4030214435554407
-0.3981448072927711   0.4129402446440287  -0.1525733322646462
-0.4495367508658790   0.3145493639907902  -0.2448316223505860
-0.5336196807674358   0.5213793269519632  -0.2791593976886009
-0.3273381294809337   0.5836150435186932  -0.2379949633802778
-0.0503926557814085  -0.3123012257444598   0.2890729610145734
  0.1544613415169517  -0.2470127423585262   0.3306528241476772
  0.0893648796576819  -0.4214848077545182   0.4141745183560049
  0.0408280440608579  -0.5180565957532047   0.3210155148071788
  0.0271235257746958   0.2794299746871916  -0.0587330572093161
  0.0713776994070941   0.1744237046862711   0.0009748038531056
  0.1985727597505359   0.2010338400010224   0.0823836508906312
-0.0159886046671891   0.0466747206588069  -0.0249289376892100
-0.2315492568766134  -0.1094021566746895  -0.1325821418821634
-0.1473235715762424   0.0170013192125558  -0.1085144374831663
-0.1938618315896677   0.1198283368852928  -0.1691005221631442
-0.1478945931714991   0.3530329950731498  -0.2010893701934673
-0.3554609430473288   0.3846486205449858  -0.2074748659836231
-0.3878664185781496   0.4994005183990484  -0.2642289775185213
-0.3279091510761905   0.4729326001983865  -0.3595227413494677
-0.0157030938695607  -0.2854591494497558   0.0662781914245647
-0.0599572675019591  -0.1803550445563298   0.0065779681367989
-0.1871523278454008  -0.2070630147635866  -0.0748385166753826
  0.0274090365723242  -0.0525082256363598   0.0324893474537704
  0.2429696887817484   0.1033729819121251   0.1401272760974120
  0.1587440034813774  -0.0230304939751201   0.1161284232544601
  0.2051395080959886  -0.1258653066219549   0.1767040693155992
  0.1594577804754483  -0.3589565399691108   0.2086525808022106
  0.0962171388007629  -0.3319830619251577   0.3042416817147713
  0.1334762978912661  -0.4477417842624700   0.3593235716503986
  0.3391868275825113  -0.4788717350425428   0.3669962231644883
  0.3668813749524639  -0.3906777953075501   0.2150200001988717
  0.3992868504832847  -0.5053318582691071   0.2717817495084258
-0.0847967068956278   0.3259538871625934  -0.2966965474995228
-0.1220558659861310   0.4417126094999058  -0.3518472889911951
-0.0271235257746958  -0.2794299746871916   0.0587330572093161
-0.0713776994070941  -0.1744237046862711  -0.0009748038531056
-0.1985727597505359  -0.2010338400010224  -0.0823836508906312
  0.0159886046671891  -0.0466747206588069   0.0249289376892100
  0.2315492568766134   0.1094021566746895   0.1325821418821634
  0.1473235715762424  -0.0170013192125558   0.1085144374831663
  0.1938618315896677  -0.1198283368852928   0.1691005221631442
  0.1478945931714991  -0.3530329950731498   0.2010893701934673
  0.3554609430473288  -0.3846486205449858   0.2074748659836231
  0.3878664185781496  -0.4994005183990484   0.2642289775185213
  0.3279091510761905  -0.4729326001983865   0.3595227413494677
  0.0157030938695607   0.2854591494497558  -0.0662781914245647
  0.0599572675019591   0.1803550445563298  -0.0065779681367989
  0.1871523278454008   0.2070630147635866   0.0748385166753826
-0.0274090365723242   0.0525082256363598  -0.0324893474537704
-0.2429696887817484  -0.1033729819121251  -0.1401272760974120
-0.1587440034813774   0.0230304939751201  -0.1161284232544601
-0.2051395080959886   0.1258653066219549  -0.1767040693155992
-0.1594577804754483   0.3589565399691108  -0.2086525808022106
-0.0962171388007629   0.3319830619251577  -0.3042416817147713
-0.1334762978912661   0.4477417842624700  -0.3593235716503986
-0.3391868275825113   0.4788717350425428  -0.3669962231644883
-0.3668813749524639   0.3906777953075501  -0.2150200001988717
-0.3992868504832847   0.5053318582691071  -0.2717817495084258
  0.0847967068956278  -0.3259538871625934   0.2966965474995228
  0.1220558659861310  -0.4417126094999058   0.3518472889911951
-0.1034976641402865   0.2470561711212705  -0.1409654873664494
  0.1149180960454216  -0.2529875109913291   0.1485871109123991
  0.1034976641402865  -0.2470561711212705   0.1409654873664494
-0.1149180960454216   0.2529875109913291  -0.1485871109123991
-0.3060675750576197   0.0965803810559547  -0.2410902484682101
  0.1020701101521446   0.3902602038122083  -0.0367954865560300
  0.3173452515639405  -0.1025195159001111   0.2485637302832306
-0.0906496782470096  -0.3961915436822669   0.0444171101019797
  0.3060675750576197  -0.0965803810559547   0.2410902484682101
-0.1020701101521446  -0.3902602038122083   0.0367954865560300
-0.3173452515639405   0.1025195159001111  -0.2485637302832306
  0.0906496782470096   0.3961915436822669  -0.0444171101019797



但真的没看出错误到底是出在了哪里,呵呵,求高手指点一下!!
谢谢
7楼2011-11-19 15:19:16
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 15 个回答

pyuting

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖


uuv2010(金币+1): 多谢提示 2011-11-18 23:09:03
daidai~(金币+2): 2011-12-05 17:02:46
引用回帖:
1楼: Originally posted by daidai~ at 2011-11-17 15:57:57:
在用vasp进行优化晶体时,出现了这样的错误信息,但不知道根本原因在什么地方,麻烦各位大侠指导一下啊!!
以下是 out 文件的内容:
running /opt/vasp/bin/vasp-intel.mpich on 16 LINUX ch_p4 processors
C ...

你看一下是不是INCAR中的NSW设置错了,结构优化时不能是1哦,正常都会是100、150左右,你试试……
2楼2011-11-18 12:58:40
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

seaso

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖


贺仪(金币+1): 多谢指教! 2011-11-18 16:24:55
The distance between some ions is very small                           |
|      please check the nearest neigbor list in the OUTCAR file               |
|          I HOPE YOU KNOW, WHAT YOU ARE  DOING         

这里不是提示了吗?
3楼2011-11-18 13:02:05
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

zyuea

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖


uuv2010(金币+1): 多谢提示 2011-11-18 23:09:08
如果能正常算就不用管他,如果不能算就检查一下POSCAR,坐标有没有弄错
4楼2011-11-18 18:31:19
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
信息提示
请填处理意见