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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » DS/Sybyl/Autodock » 使用autodock4.2处理分子对接问题，在run autogrid时总是出错，请各位高人指点啊？？
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zhuling5798

新虫 (初入文坛)

[求助] 使用autodock4.2处理分子对接问题，在run autogrid时总是出错，请各位高人指点啊？？ 已有3人参与

前期处理：按照说明书1.准备receptor分子2.准备Ligand分子3.准备柔性残基文件4.准备大分子5.准备AutoGrid参数文件6.运行Autogrid4，Run → Run AutoGrid… ，总是在第六步出现问题，望各位高人指点啊~~~
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1楼 2011-11-17 12:56:35
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fearless_

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★
ghcacj(金币+1): 谢谢 2011-11-22 13:25:39
最好别用最新版本的，容易出问题。换个版本试试
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2楼2011-11-21 23:25:28
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xzxueren

铜虫 (正式写手)
我也遇到了类似问题，不知什么原因。
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3楼2012-01-10 11:29:15
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longdlut

捐助贵宾 (著名写手)
没有碰到过类似的问题
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4楼2012-04-03 20:21:52
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wqx1990

铁虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与，应助指数 +1
jiaoyixiong: 金币+2, 鼓励交流 2012-04-19 08:02:26
这个事因为你的路径设置的有问题，因为在指定的文件夹里找不到对应的PDBQT的文件，建议你可以将默认路径设置好，而不是在进行autogrid和autodock的时候去设置路径，我碰到类似的问题都是这样去解决的。希望对你有帮助
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5楼2012-04-18 23:44:50
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947409574

新虫 (初入文坛)
我也遇到类似问题，至今还未解决
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6楼2013-12-10 08:45:26
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tbw258

铜虫 (初入文坛)
月只蓝: 应助指数-1, 鼓励参与讨论，但非应助，请勿选择应助回帖！ 2014-03-31 17:02:32
我run GRID 没问题  RUN docking 时问题多多怎么办呢
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我来了~~
7楼2013-12-28 13:57:56
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netscaner

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★
月只蓝: 金币+1, 鼓励交流！ 2014-03-31 17:02:36
文件名命名有问题，文件名字符串里不要有空格之类的，最好只用英文字母和数字组成
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天道酬勤！
8楼2013-12-28 16:55:44
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mrsuea

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

★
月只蓝: 金币+1, 鼓励交流！ 2014-03-31 17:02:50
在browse下打开目录读取，不出现这个 ，可是没有生成map啊
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9楼2014-03-30 22:55:27
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柯艳萍

铜虫 (初入文坛)
★
月只蓝: 金币+1, 鼓励交流！ 2014-04-24 18:08:48
路径有问题
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10楼2014-04-23 19:31:56
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