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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 生物科学 » 关于转录因子调控的下游基因
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qurande

金虫 (小有名气)

[求助] 关于转录因子调控的下游基因

目前有一个转录因子，但是其调控的下游基因不清楚，请教大家有什么技术能够定位其下游基因，或者有什么生物信息学的方法来预测一下，青霉菌的
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1楼 2011-11-09 16:44:30
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wen1023tao

铜虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
体内验证（chip）和体外验证（EMSA
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9楼2012-02-24 13:57:38
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brightfuture01

木虫之王 (文坛精英)

我爱打老虎

文献杰出贡献

【答案】应助回帖

★ ★
看天(金币+2): 鼓励回答 2011-11-09 17:06:05
我觉得可以先做一个类似凝胶阻滞迁移试验，看看其结合的DNA序列。然后设计引物向下游测序，测上几十KB就差不多了。
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The world is a fine place and worth fighting for. I agree with the second part.
2楼2011-11-09 16:55:38
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linyingjia

至尊木虫 (职业作家)

【答案】应助回帖

蛋白与dna相互作用的实验呢
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3楼2011-11-09 19:08:33
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xenopus

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

可以敲除该转录因子，大规模测序看基因表达量变化。不过这样有很多会是假阳性，并且直接和间接的靶基因可能都有变化，需要继续实验验证吧。
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4楼2011-11-10 08:36:22
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