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qurande

金虫 (小有名气)

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[求助] 关于转录因子调控的下游基因

目前有一个转录因子，但是其调控的下游基因不清楚，请教大家有什么技术能够定位其下游基因，或者有什么生物信息学的方法来预测一下，青霉菌的

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1楼 2011-11-09 16:44:30

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terry130

木虫 (正式写手)

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性别: GG
专业: 细胞死亡

【答案】应助回帖

转录因子一半都结合在被调控基因的promoter区域，你可以做一个chip-seq实验，然后在基因组数据库中定位这些与该转录因子结合的DNA区域，那么这些区域的下游附近的基因就很可能是受该转录因子调控的基因。然后在针对这些疑似基因做转录因子KO之后的该基因mRNA水平检测（realtimePCR）确定是否受其调控。