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qurande

金虫 (小有名气)

[求助] 关于转录因子调控的下游基因

目前有一个转录因子,但是其调控的下游基因不清楚,请教大家有什么技术能够定位其下游基因,或者有什么生物信息学的方法来预测一下,青霉菌的
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cy0708040

铁虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

参考ChIP-seq技术
Survive, Strive, Thrive
5楼2011-11-10 12:38:49
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brightfuture01

木虫之王 (文坛精英)

我爱打老虎

文献杰出贡献

【答案】应助回帖

★ ★
看天(金币+2): 鼓励回答 2011-11-09 17:06:05
我觉得可以先做一个类似凝胶阻滞迁移试验,看看其结合的DNA序列。然后设计引物向下游测序,测上几十KB就差不多了。
The world is a fine place and worth fighting for. I agree with the second part.
2楼2011-11-09 16:55:38
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linyingjia

至尊木虫 (职业作家)

【答案】应助回帖

蛋白与dna相互作用的实验呢
3楼2011-11-09 19:08:33
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xenopus

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

可以敲除该转录因子,大规模测序看基因表达量变化。不过这样有很多会是假阳性,并且直接和间接的靶基因可能都有变化,需要继续实验验证吧。
4楼2011-11-10 08:36:22
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