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想设计siRNA片段,寻求帮助,懂这方面设计的朋友,请进,谢谢!
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想针对细胞中一种酶的mRNA来设计特异性较强的siRNA片段,阻断它的翻译 过程,考察药物发挥作用是否与该酶直接相关。我用过一些在线的软件来寻找,发 现它们提供的siRNA片段与人体其他基因的同源性还是很高,没能找到较好的片段。 现在希望懂得这方面的朋友不吝赐教,提供一些较好的软件或者在线设计的网址。 |
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小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖
2011加油(金币+3): 谢谢你的热情帮助 2011-11-13 20:25:26
2011加油: 回帖置顶 表扬一下 2011-11-13 20:35:06
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http://sidirect2.rnai.jp/ 这个网址试过了吗,我用还不错 基本规则分享一下 1.sense链’5’与3’端的3个碱基中A/U含量不对称。 2.sense链的第1个碱基为G/C 3.sense链的第6个碱基为A 4.sense链的第19个碱基为A/U 5.sense链的第1个碱基不是U 6.sense链的第19个碱基不是G 另外,GC含量在31.6%-57.9% 文中指出,明显有效的siRNA序列需要满足3’端的3个碱基中A/U数量比5’端的3个碱基中A/U数量至少多1个,而且至少满足第2,3,4点中的两点。 [ Last edited by cdl007 on 2011-11-13 at 15:48 ] |
16楼2011-11-13 15:45:35
3楼2011-11-08 22:14:16
7楼2011-11-10 07:31:52
8楼2011-11-10 08:36:29
9楼2011-11-11 14:21:17
12楼2011-11-11 21:50:36
13楼2011-11-11 22:04:05
14楼2011-11-12 11:47:12
15楼2011-11-12 21:01:19
17楼2011-11-13 20:16:06
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2011加油2楼
2011-11-08 21:59
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wasxnbe4楼
2011-11-08 22:27
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2011加油(金币+1): 呵呵,应该说话发表言论的,只发图片,难道是此时无声胜有声。谢谢顶贴 2011-11-09 13:42:31
2011加油5楼
2011-11-09 13:45
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2011加油6楼
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2011加油(金币+1): 谢谢 2011-11-13 08:48:34

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跳跳鱼18楼
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