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关于过渡态和能量优化的问题
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ts优化过渡态的时候，用gaussview画过渡态，是把连接的两个分子靠近还是用虚线连起来？ 另外，怎么判断优化出来的结构是global minimum还是local minimum？我曾经想计算一个旋转能垒，由于分子自身对称性，旋转之后又回到原来的构型。所以我直接画图转到能量最高的构型，但是优化出来的还是原来的构型，怎么解决这问题？ |
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4楼2011-11-08 22:42:18
wolfzhong
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【答案】应助回帖
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gmy1990(金币+2): 2011-11-08 12:47:07
ldzh0531(金币+4): 谢谢，旋转势能面的问题能不能详细点呢 2011-11-08 20:08:09
gmy1990(金币+2): 2011-11-08 12:47:07
ldzh0531(金币+4): 谢谢，旋转势能面的问题能不能详细点呢 2011-11-08 20:08:09
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1.你连和不连，他就在那里，只是在gv里一个现实罢了。过渡态不好找，除了一些简单的之外（个人认为）。 2.GM或LM的问题，凭当个结构是无法判断的，关键是要找出所有可能的结构，来比较他们的能量那个最低，才能得到GM；例如一个六环glucose分子就有100多个结构，你得将这些全部找全。文献中间有时声称的GM其实不是，因为设计的构型不够多。 3.旋转的势能面比较简单，若重叠式和交叉式的对称性不同，可直接通过优化对应对称性结构得到；对于对称性相同的情况下，可用opt=(ModRedun)限制两个ligands的二面角得到重叠式。 |
2楼2011-11-08 12:44:01
3楼2011-11-08 20:12:13
wolfzhong
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5楼2011-11-09 02:46:30
40