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xiaoyingw

金虫 (小有名气)

[求助] 怎么随机加特定数目的水分子

盒子里自动加水时是把密度加到1,现在我只是想加一定数目的水分子,密度可能只有0.5,可是用gromacs加水的时候,程序自动把水加在盒子的一半,另一半是空的,我想要这些特定数目的水分子在盒子中是随机分布的,怎么办?求助
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shengxiang

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖


ghcacj(金币+1): 谢谢 2011-11-08 22:07:50
你这样加进去,稍微跑跑动力学进行了,没什么问题的
2楼2011-11-08 11:18:30
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xiaoyingw

金虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by shengxiang at 2011-11-08 11:18:30:
你这样加进去,稍微跑跑动力学进行了,没什么问题的

关键我是要看另外的分子在水中的动力学过程,一跑MD,没有浸在水里的那部分分子结构变化就没有参考价值了
向前冲!!!
3楼2011-11-08 14:13:29
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