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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » MS » 边界条件、温度、几何优化的问题求助
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lbh_xt

新虫 (小有名气)

[求助] 边界条件、温度、几何优化的问题求助

求高手帮助：
（1）MS建模分子动力学模拟，如果我想模拟的整个体系的边界是周期性的（xyz均为周期性的），该怎么设置呢？我想设置初始温度为300K，该怎么设置呢？
这些设置是在castep中进行设置？还是在刚开始bulid 体系的时候就要进行设置呢？

（3）如果在加有温度的情况下，想分时间分系综对系统进行模拟以求稳态，该怎么办。

（2）刚开始进行几何优化的时候，我看好多都是build  a primitive cell来进行优化的，可是如果是进行体内的随机掺杂的话，是不是应该对整个体系进行优化呢？
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安静
1楼 2011-11-07 20:56:31
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czgchd

金虫 (著名写手)
★ ★ ★
御剑江湖(金币+3): 谢谢 2011-11-13 20:11:49
密度泛函解决的问题应该是0K的时候，好像不能加温度！！！
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风轻云淡，快乐过好每一天！！
4楼2011-11-12 17:20:18
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czgchd

金虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★
御剑江湖(金币+4): 谢谢 2011-11-10 21:14:37
lbh_xt(金币+5): 谢谢哈，明白了，我还想问一下，这个优化体系的话，3X3X40UC的体系能算吗？会不会很慢？ 2011-11-12 16:35:10
我的理解是：
1，在建模的时候就已经带啦周期性边界条件，如果想取消，是在BUILD中的MAKE P1
2，优化的时候，让选择原始包，是为了更快，如果参杂，就不应该转化为原始包 ，就是对所建立的包优化
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风轻云淡，快乐过好每一天！！
2楼2011-11-10 14:56:22
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lbh_xt

新虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by czgchd at 2011-11-10 14:56:22:
我的理解是：
1，在建模的时候就已经带啦周期性边界条件，如果想取消，是在BUILD中的MAKE P1
2，优化的时候，让选择原始包，是为了更快，如果参杂，就不应该转化为原始包 ，就是对所建立的包优化

还有外界温度如何加呢？
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安静
3楼2011-11-12 16:45:49
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