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边界条件、温度、几何优化的问题求助
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求高手帮助： （1）MS建模分子动力学模拟，如果我想模拟的整个体系的边界是周期性的（xyz均为周期性的），该怎么设置呢？我想设置初始温度为300K，该怎么设置呢？ 这些设置是在castep中进行设置？还是在刚开始bulid 体系的时候就要进行设置呢？ （3）如果在加有温度的情况下，想分时间分系综对系统进行模拟以求稳态，该怎么办。 （2）刚开始进行几何优化的时候，我看好多都是build a primitive cell来进行优化的，可是如果是进行体内的随机掺杂的话，是不是应该对整个体系进行优化呢？ |
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