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lbh_xt

新虫 (小有名气)

[求助] 边界条件、温度、几何优化的问题求助

求高手帮助:
(1)MS建模分子动力学模拟,如果我想模拟的整个体系的边界是周期性的(xyz均为周期性的),该怎么设置呢?我想设置初始温度为300K,该怎么设置呢?
这些设置是在castep中进行设置?还是在刚开始bulid 体系的时候就要进行设置呢?

(3)如果在加有温度的情况下,想分时间分系综对系统进行模拟以求稳态,该怎么办。

(2)刚开始进行几何优化的时候,我看好多都是build  a primitive cell来进行优化的,可是如果是进行体内的随机掺杂的话,是不是应该对整个体系进行优化呢?
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安静
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czgchd

金虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★
御剑江湖(金币+4): 谢谢 2011-11-10 21:14:37
lbh_xt(金币+5): 谢谢哈,明白了,我还想问一下,这个优化体系的话,3X3X40UC的体系能算吗?会不会很慢? 2011-11-12 16:35:10
我的理解是:
1,在建模的时候就已经带啦周期性边界条件,如果想取消,是在BUILD中的MAKE P1
2,优化的时候,让选择原始包,是为了更快,如果参杂,就不应该转化为原始包 ,就是对所建立的包优化
风轻云淡,快乐过好每一天!!
2楼2011-11-10 14:56:22
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lbh_xt

新虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by czgchd at 2011-11-10 14:56:22:
我的理解是:
1,在建模的时候就已经带啦周期性边界条件,如果想取消,是在BUILD中的MAKE P1
2,优化的时候,让选择原始包,是为了更快,如果参杂,就不应该转化为原始包 ,就是对所建立的包优化

还有外界温度如何加呢?
安静
3楼2011-11-12 16:45:49
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czgchd

金虫 (著名写手)

★ ★ ★
御剑江湖(金币+3): 谢谢 2011-11-13 20:11:49
密度泛函解决的问题应该是0K的时候,好像不能加温度!!!
风轻云淡,快乐过好每一天!!
4楼2011-11-12 17:20:18
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