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farawaylcr

铜虫 (小有名气)

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[求助] 利用高代RIL群体定位基因

菜鸟对遗传学尤其是群体遗传学一窍不通，请专家们指导啊，金币不多，见谅了。。。。。。

现在有几百个单株的六倍体小麦RIL群体，但是，如何定位控制某一性状的单基因（初步研究结果）呢？？
可以用普通的分子生物学方法，也可以用SNP array，Bulk segregart analysis等方法，如果能具体点说明最好，多谢了。。。

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1楼2011-11-07 15:12:35

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wanhscn

木虫 (职业作家)

哲学@草根

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引用回帖:

1楼: Originally posted by farawaylcr at 2011-11-07 15:12:35:
菜鸟对遗传学尤其是群体遗传学一窍不通，请专家们指导啊，金币不多，见谅了。。。。。。

现在有几百个单株的六倍体小麦RIL群体，但是，如何定位控制某一性状的单基因（初步研究结果）呢？？
可以用普通的分子 ...

首先,先要对表型进行分析,表型数据的次数分布图可以看出其是由单基因控制还是多基因QTL, 你用的是RIL, 根据我的经验RIL一般是做数量性状QTL较多, 对于单基因, F2或者F2:3就可以定位.
RIL构建时间长,F2或者F2:3构建时间短!
其次可按照2 楼的说法!

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真相是最大的奢侈品

7楼2011-11-11 12:21:58

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wujt

铜虫 (正式写手)

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【答案】应助回帖

★ ★ ★
farawaylcr(金币+10): 谢谢你。如何利用SNP array来做呢？ 2011-11-09 12:09:56
缺友情(金币+3, 农林EPI+1): 优秀应助，授予EPI，欢迎常来农林版！ 2011-11-10 18:28:51

利用BSA方法：
1. 调查单株性状数据，挑选极端性状单株（各5-10株，例如定位控制株高基因，就挑选最高的5株和最矮的5株），提取DNA，分别混合成高低池。
2. 利用覆盖全基因组的标记（SSR，SNP，Indel等）对高低池进行筛选，寻找多态性标记。
3. 利用多态性标记在定位群体（初步定位群体200株左右）中寻找交换（重组）单株。
4.利用多态性标记，构建遗传图谱，根据重组率，得到遗传距离，即初步定位结果。
建议你多看看专业书，上面都有很多介绍的！

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