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H-xiangzhu

金虫 (正式写手)

[求助] 微生物胞内物质与胞外代谢产物提取

我要提取微生物胞内和胞外代谢产物,要去除杂蛋白质和菌体等,离心沉淀后,
1、上清液我加入草酸沉淀,后面加入丙酮溶解后离心去沉淀,请问丙酮我怎么去除呢?
2、对于胞内蛋白,我加入无水乙醇超声波破碎,后面离心去除沉淀,可是我的上清液中有无水乙醇,请问用什么方法可以把无水乙醇去除呢?

补充:1、我试验样品很少,就只有小几ml这样
      2、我们实验室只有真空泵,没有旋转蒸发仪和吹氮仪
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HarveyWang

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zhang8826857(金币+1): 鼓励交流 2011-11-14 09:21:22
引用回帖:
12楼: Originally posted by H-xiangzhu at 2011-11-11 09:46:28:
我的是放线菌发酵液,我要测杀虫活性物质,然后确定是胞内还是胞外的,是大分子还是小分子物质。

原来这样啊。先看有没有,根本不用向代谢组学一样麻烦。
步骤如下:

1.测定胞外的活性物质:

用灭菌的EP管,无菌取样,然后10000rpm 离心5min,什么放线菌或细菌都会沉下去,然后用无菌的1% NaCl稀释发酵离心上清液一系列浓度。然后做抑菌圈实验。


2.胞内的活性物质:
由于不能确定是溶于有机溶剂的还是水溶性的。故拿细胞破碎液来做。
取菌丝沉淀,用无菌的1% NaCl清洗两遍,以洗掉发酵液。
离心沉淀菌丝体,然后用1% NaCl超声破碎,此时菌丝体越浓越好。

破碎液分为两份:
A份用1% NaCl稀释一下,然后10000rpm 离心20min,上清液用无菌的NaCl稀释一系列梯度,做抑菌圈实验。

B份用有机溶剂,例如无水乙醇或丙酮等萃取,然后蒸干或风干(步骤见前面我说的)。最好用丙酮来做,丙酮容易蒸掉。最后的干燥物用灭菌的1% NaCl稀释一下,做抑菌圈实验。


3.抑菌圈实验:
在平板上涂目的细菌,例如八叠球菌或葡萄球菌等。
用那种灭菌的不锈钢筒(内径大约为4mm,高度大约为1cm,没有底)扣在此平板上。
每个平板可以扣4-8个。
然后向圈内加20uL或50uL的上面的抑菌物质稀释液。
用卡那霉素或青霉素做阳性对照。

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【我一直认为做土匪很性感很坏,很直接,可以大声喊:JCMM我爱你!所以,我自从博士毕业后,就一直在寻找黑道大哥一起去抢钱、抢粮、抢地盘】
13楼2011-11-11 19:00:37
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547star

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖


zhang8826857(金币+1): 鼓励积极回帖交流 2011-11-07 13:07:55
放可以带抽真空嘴的干燥器中自然挥发干燥(放烘干的硅胶)或辅助抽真空干燥。
为什么
2楼2011-11-07 13:02:19
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H-xiangzhu

金虫 (正式写手)

引用回帖:
2楼: Originally posted by 547star at 2011-11-07 13:02:19:
放可以带抽真空嘴的干燥器中自然挥发干燥(放烘干的硅胶)或辅助抽真空干燥。

那我怎么判断溶剂是否蒸发完全呢?
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3楼2011-11-07 13:56:38
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HarveyWang

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【答案】应助回帖

★ ★ ★
zhang8826857(金币+3): good,看lz的反馈,lz反馈好可以向版主申请个EPI啊^_^ 2011-11-07 14:14:07
H-xiangzhu(金币+1): 2011-11-07 15:23:40
1.我一般就是放在通风橱几个小时,丙酮很快就挥发完了。剩余的主要是水分溶液。
乙醇的较难挥发,几个小时后放在40摄氏度的抽真空的恒温箱中,大约一个小时可以抽完剩余水分。

2.注意事项!
这时候要注意,你到底是测什么?!!
例如你要是测定发酵液的乙酸,肯定是要再抽之前加6M NaOH少许,将溶液变碱。因为在酸性条件下,乙酸在最后快抽干的时候要挥发的!

3.无论是丙酮还是乙醇,除蛋白的效果走不足以立即上液相柱子。其中会有不少的蛋白残留。即使是使用80%以上的乙醇。不信,你可以拿BSA蛋白做下测试,看看跟三氯乙酸相比,能不能有多少蛋白沉淀。

但是,这一步中有一个很好的去处蛋白的方法。就是最后的干燥抽真空步骤。当接近干燥的时候,所有的细胞蛋白都回变性沉淀的!

就是说,对于干燥抽干的样品,你只要用水溶液溶解,然后10000 rpm离心5-10分钟,上清中就几乎没有蛋白了。

细胞蛋白都回变成一团沉在管子的底部。上清你可以直接上样过柱子。

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【我一直认为做土匪很性感很坏,很直接,可以大声喊:JCMM我爱你!所以,我自从博士毕业后,就一直在寻找黑道大哥一起去抢钱、抢粮、抢地盘】
4楼2011-11-07 14:10:46
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