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caijj09

木虫 (职业作家)

[求助] 有关MS 的建模 优化及计算的一些问题

最近在自学MS,也一直在论坛里逛,但对MS还是了解皮毛。现在遇到一些问题,希望各位MS高手能帮忙解答。

1, 如果我要构建带电的基团,如硫酸根,该怎么构建? 请给出能够看懂并进行操作的步骤(现在掌握了构建晶体, 团簇, 表面,超胞,多层结构)

2,在用CASTEP进行结构优化时,Energy 图如图1所示,一直在振荡,这个时候该设置哪些参数?怎么设置参数?(看网上的帖子,有设SCF, K-point。 我模拟的是过渡金属Ni,及主族金属Sn,金属氧化物,对这些体系我该如何设置参数?)

图1:优化结构时振荡的Energy 图
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自强不息
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流星雨

铜虫 (小有名气)

★ ★ ★ ★
chaizhm(金币+4): 谢谢~ 2011-12-19 11:23:13
参数的设置不同体系、不同模型,都不一样,建议你参看和你研究的类似的文献中的参数设置。
团簇模型的构建与周期性超胞模型前面都一样,只是在build-supercell之后,如果要做周期性计算,则应选择build>Crystals>build  vaccum  slab,其中真空层通常选择10埃以上。如果建立团簇模型则选择build>Symmetry>Non-periodic Structure,去掉模型的周期性,并跟据自己的实际需要删除部分原子,得到想要的团簇模型。
衣带渐宽终不悔
6楼2011-12-18 22:40:18
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青菜001

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
caijj09(金币+5): 谢谢啦!还想再了解下,在对这样的结构进行优化时,怎么设置参数?有哪些需要注意的地方? 2011-11-06 20:46:02
zh1987hs(金币+5): 谢谢 2011-11-06 22:27:57
第一个问题:直接更改硫元素的电荷就行(从properties中的电荷),这样就变成了硫酸根粒子了,要确定是那个元素上带的电荷。
第二个就没有涉及这一块
有问题可以私下里探讨,1986319688@qq.com
3楼2011-11-06 19:34:32
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青菜001

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★
caijj09(金币+5): 非常感谢! 2011-11-07 18:15:20
zh1987hs(金币+2): 谢谢 2011-11-07 19:25:01
zh1987hs(金币+2): 谢谢 2011-11-07 19:25:03
zh1987hs(金币+2): 谢谢 2011-11-07 19:25:22
我没用过这么复杂的像硫酸根离子这样的,但是我用过像氯离子的,没有优化,我觉得应该是带上电荷后再进行正常顺序的优化(这仅代表我个人观点,不一定对)
有问题可以私下里探讨,1986319688@qq.com
4楼2011-11-07 15:43:33
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qujinfeng

金虫 (小有名气)

团簇怎么建模啊?求指教
5楼2011-12-16 17:52:10
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