应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

Znn3bq.jpeg
小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » MS » 有关MS 的建模 优化及计算的一些问题
71/1返回列表
查看: 2801  |  回复: 6
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看

caijj09

木虫 (职业作家)

[求助] 有关MS 的建模 优化及计算的一些问题

最近在自学MS，也一直在论坛里逛，但对MS还是了解皮毛。现在遇到一些问题，希望各位MS高手能帮忙解答。

1， 如果我要构建带电的基团，如硫酸根，该怎么构建？ 请给出能够看懂并进行操作的步骤（现在掌握了构建晶体， 团簇， 表面，超胞，多层结构）

2，在用CASTEP进行结构优化时，Energy 图如图1所示，一直在振荡，这个时候该设置哪些参数？怎么设置参数？（看网上的帖子，有设SCF, K-point。 我模拟的是过渡金属Ni，及主族金属Sn，金属氧化物，对这些体系我该如何设置参数？）

图1：优化结构时振荡的Energy 图
回复此楼

» 收录本帖的淘帖专辑推荐

各种各样 计算MS等 理论计算及软件的使用

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
自强不息
1楼 2011-11-05 11:39:48
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

caijj09

木虫 (职业作家)
没人理会啊？
回复此楼
自强不息
2楼2011-11-06 13:23:43
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

青菜001

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
caijj09(金币+5): 谢谢啦！还想再了解下，在对这样的结构进行优化时，怎么设置参数？有哪些需要注意的地方？ 2011-11-06 20:46:02
zh1987hs(金币+5): 谢谢 2011-11-06 22:27:57
第一个问题：直接更改硫元素的电荷就行（从properties中的电荷），这样就变成了硫酸根粒子了，要确定是那个元素上带的电荷。
第二个就没有涉及这一块
赞一下(1人) 回复此楼
有问题可以私下里探讨，1986319688@qq.com
3楼2011-11-06 19:34:32
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

青菜001

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★
caijj09(金币+5): 非常感谢！ 2011-11-07 18:15:20
zh1987hs(金币+2): 谢谢 2011-11-07 19:25:01
zh1987hs(金币+2): 谢谢 2011-11-07 19:25:03
zh1987hs(金币+2): 谢谢 2011-11-07 19:25:22
我没用过这么复杂的像硫酸根离子这样的，但是我用过像氯离子的，没有优化，我觉得应该是带上电荷后再进行正常顺序的优化（这仅代表我个人观点，不一定对）
赞一下(3人) 回复此楼
有问题可以私下里探讨，1986319688@qq.com
4楼2011-11-07 15:43:33
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

qujinfeng

金虫 (小有名气)
团簇怎么建模啊？求指教
赞一下 回复此楼
5楼2011-12-16 17:52:10
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

流星雨

铜虫 (小有名气)
★ ★ ★ ★
chaizhm(金币+4): 谢谢~ 2011-12-19 11:23:13
参数的设置不同体系、不同模型，都不一样，建议你参看和你研究的类似的文献中的参数设置。
团簇模型的构建与周期性超胞模型前面都一样，只是在build-supercell之后，如果要做周期性计算，则应选择build>Crystals>build  vaccum  slab，其中真空层通常选择10埃以上。如果建立团簇模型则选择build>Symmetry>Non-periodic Structure，去掉模型的周期性，并跟据自己的实际需要删除部分原子，得到想要的团簇模型。
赞一下(2人) 回复此楼
衣带渐宽终不悔
6楼2011-12-18 22:40:18
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

匿名

用户注销 (著名写手)
本帖仅楼主可见
赞一下
7楼2018-01-27 14:11:21
已阅   申请模拟EPI   回复此楼   编辑   查看我的主页
相关版块跳转 我要订阅楼主 caijj09 的主题更新
71/1返回列表
普通表情 龙 兔 虎 猫
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[基金申请] RY：中国产出的科学垃圾论文，绝对数量和比例都世界第一 +7 zju2000 2026-04-14 18/900 2026-04-16 11:36 by 欢乐颂叶蓁
[考研] 初试324 中药学 一志愿天中医 求调剂 +4 李的Lucky 2026-04-10 4/200 2026-04-16 09:22 by fqwang
[考研] 279学硕食品专业求调剂院校 20+7 孤独的狼爱吃羊 2026-04-12 29/1450 2026-04-16 09:00 by screening
[考研] 求调剂推荐 +8 小聂爱学习 2026-04-14 8/400 2026-04-16 07:22 by 学员JpLReM
[考研] 求调剂 +11 小聂爱学习 2026-04-11 15/750 2026-04-15 21:57 by noqvsozv
[考研] 一志愿A区211，22408 321求调剂 +6 随心所欲☆ 2026-04-15 7/350 2026-04-15 21:45 by lbsjt
[考研] 22专硕求调剂 +9 haoyun上岸 2026-04-11 11/550 2026-04-15 14:47 by elainzaizai
[考研] 药学305求调剂 +7 玛卡巴卡boom 2026-04-11 7/350 2026-04-15 13:21 by 西北望—风沙
[考研] 材料工程281还有调剂机会吗 +43 xaw. 2026-04-11 44/2200 2026-04-15 12:46 by 西北望—风沙
[考研] 335求调剂 +19 想上岸呀！！ 2026-04-12 21/1050 2026-04-14 16:23 by Art1977
[考研] 305求调剂 +8 玛卡巴卡boom 2026-04-11 8/400 2026-04-14 09:04 by pengliang8036
[考研] 求调剂 +12 璃茉一定上岸 2026-04-10 13/650 2026-04-14 00:08 by Equinoxhua
[考研] 346分，工科0854求调剂，专硕 +6 moser233 2026-04-12 7/350 2026-04-12 22:11 by fqwang
[考研] 2本，初试303，0860求调剂 +6 floriea 2026-04-12 8/400 2026-04-12 18:13 by zhouxiaoyu
[考研] 297求调剂 +9 Kwgyz 2026-04-09 9/450 2026-04-11 10:09 by zhq0425
[考研] 调剂 +12 卷卷卷心菜_ 2026-04-09 13/650 2026-04-10 22:36 by Ftglcn90
[考研] 考研调剂 +26 硕星赴 2026-04-09 27/1350 2026-04-10 22:24 by 猪会飞
[考研] 309求调剂 +14 wdhw 2026-04-10 15/750 2026-04-10 21:06 by zhouxiaoyu
[考研] 初试261 +3 Asht少 2026-04-10 6/300 2026-04-10 16:38 by Asht少
[考研] 一志愿沪9，326生物学求相关专业调剂 +4 刘墨墨 2026-04-09 4/200 2026-04-10 12:07 by pengliang8036
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭