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wzgynkmlhf

金虫 (著名写手)

[交流] list中的氢键,同一个氧上,一个有对称码,一个没有,如何处理? 已有1人参与

如题。加入bond $h htab命令后精修,在list文件中找到,
O5-H5A         0.850    1.927   164.57    2.755    O3

O5-H5B         0.850    1.938   172.66    2.783    O1 [ -x, -y, -z+1 ]
从未见过这样子的情况,是不是我的氢加错了。如何处理呢?

这样子的情况如何处理呢?谢谢。
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wzgynkmlhf

金虫 (著名写手)

2楼2011-11-05 14:51:18
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yytsnake

至尊木虫 (职业作家)

★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖
帝夫(金币+2): 感谢回帖交流! 2011-11-06 21:22:58
是指解的结构不对称单元之外的O吧,相当于分子间的H键。
直接在INS文件里添加两个HTAB命令,同时别忘了添加EQIV命令。
3楼2011-11-05 17:23:04
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