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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » Gromacs/Amber/NAMD » 糖蛋白---分子动力学模拟
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晨光98

新虫 (初入文坛)

[交流] 糖蛋白---分子动力学模拟

请问现阶段做糖蛋白模拟，有哪些软件或者网站可以自动给具有糖基化位点的蛋白加上糖链，生成Pdb文件的？？？望高手指教怎么样做糖蛋白的动力学模拟？？
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1楼 2011-11-04 09:47:41
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灵响2010

金虫 (正式写手)
★ ★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖
chaizhm(金币+1): 谢谢交流 2011-12-05 17:56:29
jiaoyixiong(金币+2): 鼓励交流 2011-12-11 21:13:41
http://www.glycosciences.de/modeling/glyprot/php/main.php这个网站可以自动筛选哪些糖基化位点可以发生糖基化修饰，并且他还可以添加糖基化类型，比如甘露寡糖型糖基化，复杂性糖基化等等，但他只能识别PDB格式的文件。糖蛋白的动力学模拟我也在摸索，可以交流一下。哎，都是白手起家的~~~
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3楼2011-12-05 17:32:54
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晨光98

新虫 (初入文坛)
有做糖蛋白模拟的高手还望不舍赐教！！小弟不胜感激！！
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2楼2011-11-04 09:49:20
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陈应广

新虫 (初入文坛)
本人新建了一个糖蛋白分子动力学模拟交流QQ群：200436501，欢迎大家的加入！！共同探讨，共同进步！
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5楼2011-12-12 15:22:14
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