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帮我看看这个溶解qPCR曲线
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[交流]
帮我看看这个溶解qPCR曲线
做了几组定量,得到了如下的溶解曲线。
其中“问题青年”是让我上火的图,“对照1”用的同“问题青年”一样的引物,“对照2”用的同“问题青年”一样的模板
对照1
对照2
问题青年
[
Last edited by 1949stone on 2011-10-31 at 21:52
]
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5楼
:
Originally posted by
cloverplm
at 2011-10-31 20:29:24:
从图上看,“问题青年”有非特异性扩增,溶解曲线的峰图太杂,可不可以用循环数为横坐标作个图,看这几个图形的峰值起峰点是否一致,“问题青年”的实验可以多做几次比较下。
起峰点不一样,“问题青年”起峰很晚,到了30cycles以后才起峰,做了40cycles,反应完的时候还没到平台期呢,所以重做是必须的了,两个对照一个是20左右,另一个是25左右
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2011-10-31 22:21:43
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7788945(金币+1): 2011-10-31 20:15:56
你有没有把你qPCR的产物跑个电泳?我怀疑“问题青年”有非特异扩增,而且扩增效率不高,引物和模板是不是不匹配?
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2011-10-31 18:42:10
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2楼
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云霆子
at 2011-10-31 18:42:10:
你有没有把你qPCR的产物跑个电泳?我怀疑“问题青年”有非特异扩增,而且扩增效率不高,引物和模板是不是不匹配?
跑了一下,的确有非特异性扩增,这个引物和模板之前是做过好几次的,跑普通的PCR,只是有二聚体而已,但是这个定量跑完了竟然出了涂抹带
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2011-10-31 19:59:20
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7788945(金币+1): 2011-10-31 22:15:07
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3楼
:
Originally posted by
7788945
at 2011-10-31 19:59:20:
跑了一下,的确有非特异性扩增,这个引物和模板之前是做过好几次的,跑普通的PCR,只是有二聚体而已,但是这个定量跑完了竟然出了涂抹带
那你做普通的PCR与qPCR用的条件相同么?比如退火温度。
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2011-10-31 20:19:02
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