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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » MS » 建模中加H的问题
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zhxy06

金虫 (初入文坛)

[求助] 建模中加H的问题

Ms建模时，用H钝化直接用adjust hydrogen，有些原子加不上H，不知道怎么回事，如果手动，怎么加 ？望高手解答，谢谢
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1楼 2011-10-30 16:07:12
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zhxy06

金虫 (初入文坛)
★
uuv2010(金币+1): 多谢分享 2011-10-30 18:31:18
自己解决了，view-explorers-properties explorers，找到原子的坐标，
计算出要添加的原子坐标，add atom，option中改成carstesin，ok啦
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2楼2011-10-30 17:03:35
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zhxy06

金虫 (初入文坛)
★ ★
franch(金币+2): 鼓励交流，，把出错信息贴出来 2011-10-31 13:15:42
有人看到不，模型与文献一致了，但现在出现的问题是计算总是出错。是计算机的内存不够？
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3楼2011-10-31 11:54:13
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杨寻

铁杆木虫 (著名写手)
加氢键的时候老是提示 超出了坐标值 你晓不晓得怎么回事？ 谢谢
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4楼2011-11-01 19:46:01
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zhxy06

金虫 (初入文坛)
★
zzy870720z(金币+1): 鼓励交流 2011-11-03 20:13:20
没碰到过，可能坐标值设置问题
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5楼2011-11-03 10:11:27
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zhxy06

金虫 (初入文坛)
★
fzx2008(金币+1): 鼓励交流 2011-11-08 16:09:55
自己顶一下，顺便抛出新的问题，以Si的原胞为模型计算能带结构，算出是间接带隙，而改成传统单胞，却得到直接带隙，为什么呀为什么？
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6楼2011-11-08 15:29:58
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贺仪

铁杆木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★
zzy870720z(金币+2): 谢谢指教 2011-11-09 12:23:25
引用回帖:
6楼: Originally posted by zhxy06 at 2011-11-08 15:29:58:
自己顶一下，顺便抛出新的问题，以Si的原胞为模型计算能带结构，算出是间接带隙，而改成传统单胞，却得到直接带隙，为什么呀为什么？

能带折叠了，应该是你两个能量最低（高）的k点折叠到一起去了，或者就是使用超胞，你的k点没有换，这样会导致能量最低（高）的k点不在你的路劲中了
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嘟啦啦嘟啦啦嘟
7楼2011-11-09 08:49:18
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zhxy06

金虫 (初入文坛)
引用回帖:
7楼: Originally posted by 贺仪 at 2011-11-09 08:49:18:
能带折叠了，应该是你两个能量最低（高）的k点折叠到一起去了，或者就是使用超胞，你的k点没有换，这样会导致能量最低（高）的k点不在你的路劲中了

谢谢，查了一下，都说是这个原因，但怎么处理呢，换了K点重新计算？
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8楼2011-11-10 10:07:22
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贺仪

铁杆木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★
franch(金币+3): 谢谢回帖交流 2011-11-10 12:11:37
引用回帖:
8楼: Originally posted by zhxy06 at 2011-11-10 10:07:22:
谢谢，查了一下，都说是这个原因，但怎么处理呢，换了K点重新计算？

恩 是的，但是你的k点要根据你的超胞的建立来改变，确保超胞的k点路径经过能量最低点
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嘟啦啦嘟啦啦嘟
9楼2011-11-10 10:34:58
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zhxy06

金虫 (初入文坛)
引用回帖:
9楼: Originally posted by 贺仪 at 2011-11-10 10:34:58:
恩 是的，但是你的k点要根据你的超胞的建立来改变，确保超胞的k点路径经过能量最低点

只要经过，超胞的K点路径不一定就是原胞的K点路径吗？
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10楼2011-11-10 10:41:58
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