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illcf_11

银虫 (初入文坛)

[求助] 大肠杆菌基因重组时PKD46高温怎么都消除不了

小妹这些时间在做red基因重组技术,遇到pkd46质粒在高温下(42度甚至45度)还无法消除。具体步骤如下:
1、将PKD46化转到W3110中,挑取单克隆,提取质粒,初步验证后,接种至AMP培养基中30度过夜培养,次日1:1000转接至新鲜培养基,培养至OD600=0.2时加入,阿拉伯糖至终浓度100mM,继续培养到OD0.6时,制备电转感受态细胞。
2、将打靶分子(pkd3来源,氯霉素抗性)200ng左右,1800V,4.1至4.3ms电转至感受态中,37度培养2h后,涂布于氯霉素抗性的LB平板,37度过夜培养。
3、将氯霉素平板上长出的克隆,再次在氯霉素板上划线,并PCR验证基因组是否敲除。阳性结果再制备化转感受态,准备将pcp20转进去,将氯霉素抗性消除。可是次日 平板上的克隆数巨多。
推测是在制备感受态的时候之前的pkd46没有消除。于是将具有氯霉素抗性的单克隆接种至摇瓶,提高培养温度至42甚至45度,企图消除内涵的pkd46,转接数次,划线amp平板,均生长状态良好。如今我无法消除pkd46,严重影响后面转化pcp20后,阳性克隆的挑选率。
哪位高手能指教一下……到底哪里出错,或是可以怎么解决
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jndxwjl

新虫 (初入文坛)

这个pKD46去除不掉的情况我也遇到过,我改进的方法是减小接种量,然后立即置于42℃摇,3-4h划线于基因组抗性平板,并置于42℃培养,然后,选择单菌落在amp抗性平板划线,不长的单菌落,说明其pkd46已经去除。
18楼2012-10-18 22:14:10
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yanhua_2006

铁杆木虫 (著名写手)

我也有遇到类似的问题,有高人能给指点一下吗?
3楼2011-10-27 13:46:34
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wanhscn

木虫 (职业作家)

哲学@草根

点确定回帖应助!


真相是最大的奢侈品
4楼2011-10-27 16:13:09
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lloveyr

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

illcf_11(金币+10): 谢谢,目前已经解决了,是我们的PKD46温敏出了问题,换了新的质粒就好了 2011-11-24 08:41:55
这几个质粒我以前用过,好像没有楼主说的问题啊。在消除质粒时 ,培养液中不能加抗生素,然后在无抗性平板上划线,然后验证对单菌落进行氨苄敏感氯霉素抗性筛选(可以用传统的牙签点种法),同时要注意菌不要过多的接触氯霉素,否则会出现即使氯霉素基因已经消除菌仍有氯霉素抗性的情况。
5楼2011-10-28 15:05:51
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