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oceanworld

木虫 (小有名气)

[求助] BAC文库连接转化

请问一下,做BAC文库构建时,为什么大片段超过100K的总是连不上去呢,转化后经NotI酶切检测,片段大小都在30k左右,按照说明书上的步骤进行的连接,可是为什么大片段总是连不上呢?求各位帮忙!!!!谢谢
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liuzhan2705

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
19楼: Originally posted by 浅歌99 at 2013-11-28 14:36:46
楼主你好,我现在也在做BAC ,同样出现了包埋块酶切切不动的情况,请问您当时是怎么解决的啊?...

应该不是不动,而是应该有拖尾吧?这很正常,由于随机切出来的条带大小不一,所以条带总会有拖尾,可以尝试酶切时将包埋块切成25个小碎块进行部分酶切
20楼2013-11-30 22:04:01
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jinpeng_6118

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

oceanworld(金币+2): 2011-11-04 10:34:21
不知你的目的片段是否大小差不多,要是混在一起连接肯定小片段占优势,另外可以尝试连接时间延长,中间补加几次连接酶
人生百态原为海,看破红尘方为岸!
2楼2011-11-03 11:55:05
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brightfuture01

木虫之王 (文坛精英)

我爱打老虎

文献杰出贡献

【答案】应助回帖

oceanworld(金币+2): 2011-11-04 10:34:17
你的片段怎么制备的?为何30kb-100kb差这么多?可以试试用PCR仪不同温度交替这样连接。可以查查 赵茂林 的文章,他们课题组做过几个类似的项目,也发表了一些方法学文章,希望对你有帮助。
The world is a fine place and worth fighting for. I agree with the second part.
3楼2011-11-03 13:36:58
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oceanworld

木虫 (小有名气)

我割胶的时候割的是100-150kb的片段,可是连上去的却是30kb左右,连接过夜也不行啊?不知道是哪一步出问题了?
4楼2011-11-04 10:34:08
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