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caijj09

木虫 (职业作家)


[资源] 个人总结有关MS的各种问题(第一季)

目录
一 如何构建水体系,有机溶剂体系        2
问题1:MS的Amorphous cell使用出问题        2
问题2:怎么在MS中建立一个64水的盒子        4
问题3:MS中如何选择体系中的水分子        5
问题4:MS中的castep模块金属表面水分子模型的建立        5
问题5:模拟水溶液中有机物或有机离子在金属表面的吸附问题        6
二:结构优化        6
问题1:MS中forcite模块与discover模块中的结构优化有什么区别?        6
问题2:在MS中用哪个模块进行优化结构        6
问题3:用分子模拟吸附剂的吸附过程        7
问题4:MS中切面几何优化和原子之间的配位        8
问题5:如何在Dmol3模块中实现定向优化        9
问题6:MS 能量最小化出错        9
二:力场选择        10
三:吸附模拟        10
问题1:MS中sorption模块的MC计算        10
问题2:主族金属氧化物切面做吸附小分子要不要考虑自旋极化?        12
问题3:晶体表面吸附的选择性方向弛豫        13
四:模块使用        13
问题1:CASTEP 输出有几点看不懂        13
问题2:那位高手能够介绍一下MS中CASTEP的势能模型的适用范围?(分子模拟论坛)        14
问题3:CASTEP能算pdos的自旋情况吗        15
问题4:在用CASTEP计算材料空位缺陷时,如何才能实现只取一个空位        15
问题5:在CASTEP计算中,k point设置不同,对计算结果有什么影响?        15
问题6:CASTEP中几何优化问题        16
问题7:MS castep的几个empty band问题        16
问题8:如何在CASTEP中实现电荷密度图示        20
问题9:能带计算(系列)        20
问题10:Dmol3计算动力学无法收敛        22
问题11:如何在Discover计算中分别对相同环境原子分配不同力场类型        23
问题12:如何在CASTEP计算中限制某个原子的移动方向        23
问题13:如何使用DMol3进行动力学计算?        28
问题14:如何在Dmol3中考虑溶剂化效应        30
五:软件安装        31
问题1:安装步骤(windows 版)        31
问题2:license 问题        32
问题3:gataway 问题        32
六:综合        34
问题1:建模        34
问题2:价态        38
问题3:停电处理        39
问题4:求电导        40
问题5:切平面时如何切出矩形平面        40
问题6:如何使用XRD数据快速建立相关的晶体结构        40
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alienlj

铜虫 (初入文坛)


★★★★★ 五星级,优秀推荐

谢谢lz分享 看来能解决不少疑惑了
205楼2012-08-23 14:37:47
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简单回复
alienlj207楼
2012-08-24 17:06   回复  
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