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范慧

新虫 (初入文坛)

[求助] 微生物多样性研究的几个问题

1.所有的引物p出来的序列都可以建系统发育树吗
2.什么引物p出来的序列可用于建立基因文库啊    建立基因文库怎样分析哪种是优势菌群
3.连接转化选择阳性克隆进行扩增的步骤是什么
谢谢
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niyq

木虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★
zhang8826857(金币+2): good 2011-11-09 09:05:01
1.16s、持家基因都可建树,关键数据库中要有先进序列
2.第二个问题前面和第一个问题一样,关键是你p出来的基因别人也研究过,有较多的相近序列,构建文库后测序,你才能比对,否则自己跟自己比吧,所以要选对基因,你要研究那类微生物,批出来克隆了,测序了或者酶切完了,统计相同的序列,你就知道哪些是优势菌了
3.选择载体上的链接位点两侧的序列就可以直接用大肠杆菌煮沸液做模板扩增
3楼2011-11-09 00:40:06
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niyq

木虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

很简单,有的直接在pcr预混液中加1ul菌液,要是保险,你取10ul菌液在沸水中煮沸10分钟,离心一下,去菌液就可pcr
11楼2011-11-20 15:17:28
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