24小时热门版块排行榜    

查看: 1295  |  回复: 6

kouery

银虫 (小有名气)

[求助] 用SNP来做群体分类?高手来帮助小弟啊。

本人现在要做一个SNP特征选择,然后根据特征选择在对同一种群中吧不同群体进行分类,比如说对于人类,我要根据SNP位点来分类出亚洲人,欧洲人,黑人等,小弟生物信息才学不到3个月,高手求助啊,有相关的文章或者文献推荐没,谢谢大家了!
回复此楼
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

kouery

银虫 (小有名气)

2楼2011-10-25 19:57:36
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

tracyyangyi

金虫 (小有名气)

内容太泛啦,就看人类的遗传特征资料吗?打算做SNP实验不
3楼2011-10-26 10:30:11
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

kouery

银虫 (小有名气)

引用回帖:
3楼: Originally posted by tracyyangyi at 2011-10-26 10:30:11:
内容太泛啦,就看人类的遗传特征资料吗?打算做SNP实验不

呵呵 谢谢回帖哈,先根据人类的特征来做下,至于做SNP实验肯定要做的,可能是要做分类或者聚类,把不种特征的群体分类,
很多东西我也不太懂,不知道说错了没?
4楼2011-10-26 11:30:04
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

tracyyangyi

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★
adslye(金币+2): 鼓励交流~祝顺利! 2011-10-27 09:29:13
kouery(金币+5): 谢谢了 ,有所启发 !! 2011-10-28 09:52:32
做聚类的话首先要选择不同人群(有差异才可以分类),比如汉族和其他少数民族,那做什么特征就由你选择啦。至于SNP可以选择很多相关基因来做,样本量一定大才可能聚类找到差异。不知是否能解决你的困惑
5楼2011-10-27 08:34:14
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

爱淘妞妞

铁虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

kouery(金币+5): 谢谢了, 2011-10-28 09:53:05
我认为首先是搜集到差异足够大的样本,然后是确定你要做的特征,接下来就是选择基因,然后就是克隆测序分析,最后看你这个SNP怎么跟特征对映、相关。样本小了或者选择的基因不能代表特征的话就看不出对映关系了。
懒惰使人变傻
6楼2011-10-27 10:16:30
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

爱淘妞妞

铁虫 (初入文坛)

权当参考吧。因为我以前选的基因没有代表性,最后想把SNP跟居群对映起来就很难
懒惰使人变傻
7楼2011-10-27 10:17:48
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 kouery 的主题更新
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[基金申请] 如果此刻你正在为国基感到焦虑,不妨来听听这首《基金之外》 +8 scalable 2026-08-24 8/400 2026-08-25 12:52 by jnhyjjm
[基金申请] 没有任何消息-是不是就凉了 +9 图啦图啦 2026-08-24 10/500 2026-08-25 11:59 by 南海小哥
[基金申请] 人气不行了 +11 fansofjerry 2026-08-21 11/550 2026-08-25 11:04 by 孤独的英雄6
[教师之家] 导师吐槽:我怎么摊上了这么个极品研究生! +3 苏东坡二世 2026-08-23 3/150 2026-08-25 10:35 by shisan1313
[基金申请] 2026年的国家社科基金项目通讯评审的新规则与新动向、新挑战 +5 process2012 2026-08-23 7/350 2026-08-25 09:42 by huixian257
[基金申请] 我面上完蛋了 +13 且听虎啸 2026-08-20 14/700 2026-08-25 09:10 by mrkang
[基金申请] 范进中举一文的中心思想 +7 炎黄贵胄 2026-08-22 8/400 2026-08-25 08:48 by ZJTJZ
[基金申请] 明天应该可查了!? +5 chengyan1220 2026-08-23 5/250 2026-08-24 23:28 by 我4大白菜
[基金申请] 能否退出参与的面上项目解除限项 +21 koalala 2026-08-24 24/1200 2026-08-24 19:25 by 家与远方
[基金申请] filecode,4个jtjc了 +14 ziyangfang 2026-08-19 17/850 2026-08-24 18:37 by 哈哈蛤?
[基金申请] 今日不放榜?网传国自然预计 8 月 27 日可查结果 +17 医学老男孩 2026-08-20 21/1050 2026-08-24 14:21 by refreshing11
[基金申请] 让我中一个面上吧! +13 大萍1987 2026-08-20 16/800 2026-08-24 10:23 by 太傻了
[基金申请] 放榜前的不淡定 20+4 snowwithsea 2026-08-19 17/850 2026-08-24 10:20 by echo8914667
[基金申请] 什么时候开奖? +10 CrisMessi 2026-08-18 11/550 2026-08-24 06:50 by 开心的小狮子
[教师之家] 跳槽后在研项目怎么办? +5 简单化xn 2026-08-22 10/500 2026-08-23 12:38 by 简单化xn
[基金申请] 今天放榜吗? +15 布布和一二 2026-08-19 16/800 2026-08-23 09:55 by 张春生
[基金申请] 时间戳今天,20号变了 +5 archvillain 2026-08-20 5/250 2026-08-22 06:12 by hui_daxiao
[基金申请] 时间戳又变了 +13 wuchongjun 2026-08-20 19/950 2026-08-21 17:21 by 紫杉醇
[基金申请] 应该是下周三26日公布了吧? +4 哈哈蛤? 2026-08-21 4/200 2026-08-21 10:58 by Vivilian
[基金申请] 基金啊基金 +4 longfie172 2026-08-20 4/200 2026-08-21 08:58 by mark mao
信息提示
请填处理意见