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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 生物科学 » 用SNP来做群体分类？高手来帮助小弟啊。
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kouery

银虫 (小有名气)

[求助] 用SNP来做群体分类？高手来帮助小弟啊。

本人现在要做一个SNP特征选择，然后根据特征选择在对同一种群中吧不同群体进行分类，比如说对于人类，我要根据SNP位点来分类出亚洲人，欧洲人，黑人等，小弟生物信息才学不到3个月，高手求助啊，有相关的文章或者文献推荐没，谢谢大家了！
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1楼 2011-10-25 10:34:14
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kouery

银虫 (小有名气)
自己顶
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2楼2011-10-25 19:57:36
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tracyyangyi

金虫 (小有名气)
内容太泛啦，就看人类的遗传特征资料吗？打算做SNP实验不
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3楼2011-10-26 10:30:11
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kouery

银虫 (小有名气)
引用回帖:
3楼: Originally posted by tracyyangyi at 2011-10-26 10:30:11:
内容太泛啦，就看人类的遗传特征资料吗？打算做SNP实验不

呵呵 谢谢回帖哈，先根据人类的特征来做下，至于做SNP实验肯定要做的，可能是要做分类或者聚类，把不种特征的群体分类，
很多东西我也不太懂，不知道说错了没？
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4楼2011-10-26 11:30:04
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tracyyangyi

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★
adslye(金币+2): 鼓励交流~祝顺利！ 2011-10-27 09:29:13
kouery(金币+5): 谢谢了 ，有所启发 ！！ 2011-10-28 09:52:32
做聚类的话首先要选择不同人群（有差异才可以分类），比如汉族和其他少数民族，那做什么特征就由你选择啦。至于SNP可以选择很多相关基因来做，样本量一定大才可能聚类找到差异。不知是否能解决你的困惑
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5楼2011-10-27 08:34:14
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爱淘妞妞

铁虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

kouery(金币+5): 谢谢了， 2011-10-28 09:53:05
我认为首先是搜集到差异足够大的样本，然后是确定你要做的特征，接下来就是选择基因，然后就是克隆测序分析，最后看你这个SNP怎么跟特征对映、相关。样本小了或者选择的基因不能代表特征的话就看不出对映关系了。
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懒惰使人变傻
6楼2011-10-27 10:16:30
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爱淘妞妞

铁虫 (初入文坛)
权当参考吧。因为我以前选的基因没有代表性，最后想把SNP跟居群对映起来就很难
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懒惰使人变傻
7楼2011-10-27 10:17:48
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