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用SNP来做群体分类?高手来帮助小弟啊。
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kouery
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用SNP来做群体分类?高手来帮助小弟啊。
本人现在要做一个SNP特征选择,然后根据特征选择在对同一种群中吧不同群体进行分类,比如说对于人类,我要根据SNP位点来分类出亚洲人,欧洲人,黑人等,小弟生物信息才学不到3个月,高手求助啊,有相关的文章或者文献推荐没,谢谢大家了!
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内容太泛啦,就看人类的遗传特征资料吗?打算做SNP实验不
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2011-10-26 10:30:11
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3楼
:
Originally posted by
tracyyangyi
at 2011-10-26 10:30:11:
内容太泛啦,就看人类的遗传特征资料吗?打算做SNP实验不
呵呵 谢谢回帖哈,先根据人类的特征来做下,至于做SNP实验肯定要做的,可能是要做分类或者聚类,把不种特征的群体分类,
很多东西我也不太懂,不知道说错了没?
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4楼
2011-10-26 11:30:04
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★ ★
adslye(金币+2): 鼓励交流~祝顺利! 2011-10-27 09:29:13
kouery(金币+5): 谢谢了 ,有所启发 !! 2011-10-28 09:52:32
做聚类的话首先要选择不同人群(有差异才可以分类),比如汉族和其他少数民族,那做什么特征就由你选择啦。至于SNP可以选择很多相关基因来做,样本量一定大才可能聚类找到差异。不知是否能解决你的困惑
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2011-10-27 08:34:14
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kouery(金币+5): 谢谢了, 2011-10-28 09:53:05
我认为首先是搜集到差异足够大的样本,然后是确定你要做的特征,接下来就是选择基因,然后就是克隆测序分析,最后看你这个SNP怎么跟特征对映、相关。样本小了或者选择的基因不能代表特征的话就看不出对映关系了。
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2011-10-27 10:16:30
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权当参考吧。因为我以前选的基因没有代表性,最后想把SNP跟居群对映起来就很难
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2011-10-27 10:17:48
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