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菌液PCR是阳性,却提不出来阳性质粒!求助
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461241086
新虫
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[
求助
]
菌液PCR是阳性,却提不出来阳性质粒!求助
我的目的片段连接T载体后,菌液PCR可以扩增出目的基因,于是我把阳性菌的质粒提取出来再跑电泳,居然没有目的条带(T载体和目的基因共4kb)只有2500bp左右的带,谁能告诉我这是怎么回事?
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1楼
2011-10-24 21:39:17
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cdl007
木虫
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专业: 肿瘤病因
【答案】应助回帖
菌液不可靠,提出质粒跑电泳也不可靠,金标准是测序,反正现在也不贵
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18楼
2011-10-25 17:28:36
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木虫
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专业: 系统生物学
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★
wanhscn(金币+1): 鼓励应助! 2011-10-25 11:04:48
目的片段在宿主菌有相似片段?引物在宿主菌总DNA有相似扩增区?菌液PCR的引物没有使用一载体一插入片段的组合!?总之,很可能是假阳性。
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为什么
2楼
2011-10-24 22:21:23
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清风寨
银虫
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专业: 细胞生物学研究中的新方法
【答案】应助回帖
★
wanhscn(金币+1): 鼓励应助! 2011-10-25 11:06:55
你这2500的条带是不是空的T载体啊 只是大小估算错了 做菌落PCR会更方便鉴定 可以多挑点阳性的结果提质粒
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冷风过心变热
3楼
2011-10-25 08:44:36
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zc10052157
新虫
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专业: 微生物生理与生物化学
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wanhscn(金币+2): 同意! 2011-10-25 11:07:09
这样不就确定是空载了吗 菌液PCR可信度不高的
你要么再跑个质粒和酶切后质粒的电泳看看
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hold住
4楼
2011-10-25 09:14:42
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