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新虫 (初入文坛)

[求助] 菌液PCR是阳性,却提不出来阳性质粒!求助

我的目的片段连接T载体后,菌液PCR可以扩增出目的基因,于是我把阳性菌的质粒提取出来再跑电泳,居然没有目的条带(T载体和目的基因共4kb)只有2500bp左右的带,谁能告诉我这是怎么回事?
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zc10052157

新虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★
wanhscn(金币+2): 同意! 2011-10-25 11:07:09
这样不就确定是空载了吗    菌液PCR可信度不高的

你要么再跑个质粒和酶切后质粒的电泳看看
hold住
4楼2011-10-25 09:14:42
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547star

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖


wanhscn(金币+1): 鼓励应助! 2011-10-25 11:04:48
目的片段在宿主菌有相似片段?引物在宿主菌总DNA有相似扩增区?菌液PCR的引物没有使用一载体一插入片段的组合!?总之,很可能是假阳性。
为什么
2楼2011-10-24 22:21:23
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清风寨

银虫 (小有名气)

【答案】应助回帖


wanhscn(金币+1): 鼓励应助! 2011-10-25 11:06:55
你这2500的条带是不是空的T载体啊 只是大小估算错了  做菌落PCR会更方便鉴定  可以多挑点阳性的结果提质粒
冷风过心变热
3楼2011-10-25 08:44:36
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guojianping

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★
wanhscn(金币+2): yes! 2011-10-25 11:07:33
本来菌液PCR不靠谱的。可能正好宿主菌有相似的片段。都不用验证了,直接重做吧。另外换引物,验证引物20+bp一般就没什么问题了,很特异,不太会假阳性
5楼2011-10-25 09:25:40
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