| 查看: 300 | 回复: 0 | ||
zhongyunxia新虫 (小有名气)
|
[求助]
grompp时出错，两个最大电荷组半径之和大于rlist,怎么办啊？
|
|
各位高手，这个是我做的连苯三酚的top，grompp时出现错误：the sum of the largest charge group radii(83.737038) is larger than rlist(1.0) .下面为我的top,这是用produg得到的。 [ atoms ] ; nr type resnr resid atom cgnr charge mass 1 OA 1 DRG O1 1 -0.188 15.9994 2 H 1 DRG H2 1 0.046 1.0080 3 C 1 DRG C3 1 0.14 12.0110 4 C 1 DRG C4 1 0.134 12.0110 5 OA 1 DRG O5 1 -0.188 15.9994 6 H 1 DRG H6 1 0.046 1.0080 7 CR1 1 DRG C7 1 -0.008 12.0110 8 HC 1 DRG H8 1 0.024 1.0080 9 CR1 1 DRG C9 2 -0.008 12.0110 10 HC 1 DRG H10 2 0.022 1.0080 11 CR1 1 DRG C11 2 -0.008 12.0110 12 HC 1 DRG H12 2 0.022 1.0080 13 C 1 DRG C13 2 0.126 12.0110 14 OA 1 DRG O14 2 -0.198 15.9994 15 H 1 DRG H15 2 0.044 1.0080 em文件参数为 constraints =none integrator =steep dt =0.002 nsteps =500 nstlist =10 ns-type =grid rlist =1.0 coulombtype =PME rcoullomb =1.0 vdwtype =cut-off rvdw =1.0 fourierspacing =0.12 fourier-nx =0 fourier-ny =0 fourier-nz =0 ewald-rtol =le-5 optimize-fft =yes ; ;energy minimizing stuff ; emtol =1000.0 emstep =0.01 以上就是我的情况，恳请各位高手帮助，本人感激不尽！！！！！ |
回复此楼» 猜你喜欢
321求调剂
已经有5人回复
-
324求调剂
已经有6人回复
-
359求调剂
已经有7人回复
-
一志愿华北电力大学（北京），材料科学与工程学硕265，求调剂
已经有11人回复
-
368求调剂
已经有7人回复
-
288求调剂，一志愿华南理工大学071005
已经有3人回复
-
求生物学调剂
已经有13人回复
-
284求调剂
已经有3人回复
-
调剂
已经有8人回复
-
一志愿211，化学学硕，310分，本科重点双非，求调剂
已经有8人回复
找到一些相关的精华帖子，希望有用哦~
想算电荷密度，问些问题
已经有4人回复
- 2012国家公务员考试必备--公务员考试必备之：常考近义词组辨析
已经有54人回复
- 求助guassian结果分析---计算出错
已经有5人回复
- cygwin系统之下安装abinite不知什么原因出错了？
已经有6人回复
- vasp跨节点运行出错，mpiexec_node-1 (handle_stdin_input 1089)
已经有5人回复
- td做激发态优化出错
已经有19人回复
- 请教各位高手，VASP算电荷有序需要设哪些参数啊？
已经有10人回复
- WORD出错了该怎么修复啊？重装也没有用的情况！
已经有4人回复
- 请教有机分子中O原子和H原子电荷数怎么计算，O-H键键级怎么计算！谢谢！
已经有4人回复
- 博士后基金申请在打印转化成word时出错
已经有13人回复
- 【求助】求助差分电荷密度的脚本！
已经有45人回复
- 【求助】gaussian运行出错
已经有5人回复
- 【求助】求教激子波尔半径
已经有7人回复
- 【求助成功】supercell中DOS计算如何得到合理的电荷密度和波函数？
已经有3人回复
点击这里搜索更多相关资源科研从小木虫开始，人人为我，我为人人
