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贺仪

铁杆木虫 (著名写手)

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[求助] GAUSSIAN怎么计算overlap matrix？

本人非专业GAUSSIAN使用者，请问GAUSSIAN怎么计算overlap matrix ， molecular orbital coefficients and energies ？如果可以，请列出输入文件，谢谢！

F0= SCC
,没法显示……
where S is the intermolecular overlap matrix, and C and
are the dimer Kohn-Sham orbital’s coefﬁcients and energies.
The noninteracting molecular orbitals of the two individual
molecules are calculated separately by the standard self-
consistent ﬁeld procedure. These noninteracting orbitals are
then used to construct the dimer Kohn-Fock matrix. Namely,
it takes directly the unperturbed individual molecule’s orbital
and density matrix to guarantee that originally, the two mol-
ecules are noninteracting, and only when putting them to-
gether, one can get interaction information with respect to
the individual molecules in the spirit of ﬁrst-order perturba-
tion. All of the calculations are performed with the GAUSSIAN
03 package

详细的请看PHYSICAL REVIEW B 79, 115203 2009

[ Last edited by 贺仪 on 2011-10-17 at 16:20 ]

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嘟啦啦嘟啦啦嘟

1楼 2011-10-17 11:00:34

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贺仪

铁杆木虫 (著名写手)

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引用回帖:

28楼: Originally posted by sobereva at 2011-10-18 18:39:35:
两单体的HOMO的重叠积分：
<HOMO_a|HOMO_b>
=<∑c_ai*χ_ai|∑[j]c_bj*χ_bj>
=∑∑[j]c_ai*c_bj*S_ai,bj
S_ai,bj是单体a的i基函数与单体b的j基函数的重叠积分。S、c怎么获得在前面的回复 ...

c是在单体计算得到log文件中的MOlecular Orbital Coefficients
   Molecular Orbital Coefficients:
                        1       2       3       4       5
                        O       O       O       O       O
   Eigenvalues -- -14.14119 -14.13311 -10.06386 -10.05618 -10.05339
1 1 C  1S       0.00049 0.00000  -0.01306 0.00000  -0.00317
2       2S       -0.01389 0.00000  -0.00891 0.00000  -0.00026
中的 0.00049代表的是轨道1与基函数1号原子1S轨道的的C是吧？
而
“S_ai,bj是单体a的i基函数与单体b的j基函数的重叠积分”
是在超分子计算得到的Density Matrix
Density Matrix:
                        1       2       3       4       5
1 1 C  1S       2.07860
2       2S       -0.21732 0.81347
3       2PX       0.00312  -0.04906 0.70492
4       2PY       -0.00439 0.07091 0.06855 0.65157
其中的的编号1 代表是1号C原子1s轨道是吧？也就是说第一个元素2.07860是S(a1,a1)是吧？
麻烦了！谢谢您的帮助！