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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 量子化学 » Gaussian » GAUSSIAN怎么计算overlap matrix？
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贺仪

铁杆木虫 (著名写手)

[求助] GAUSSIAN怎么计算overlap matrix？

本人非专业GAUSSIAN使用者，请问GAUSSIAN怎么计算overlap matrix ， molecular orbital coefficients and energies ？如果可以，请列出输入文件，谢谢！

F0= SCC
,没法显示……
where S is the intermolecular overlap matrix, and C and 
are the dimer Kohn-Sham orbital’s coefficients and energies.
The noninteracting molecular orbitals of the two individual
molecules are calculated separately by the standard self-
consistent field procedure. These noninteracting orbitals are
then used to construct the dimer Kohn-Fock matrix. Namely,
it takes directly the unperturbed individual molecule’s orbital
and density matrix to guarantee that originally, the two mol-
ecules are noninteracting, and only when putting them to-
gether, one can get interaction information with respect to
the individual molecules in the spirit of first-order perturba-
tion. All of the calculations are performed with the GAUSSIAN
03 package

详细的请看PHYSICAL REVIEW B 79, 115203 2009

[ Last edited by 贺仪 on 2011-10-17 at 16:20 ]
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嘟啦啦嘟啦啦嘟
1楼 2011-10-17 11:00:34
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贺仪

铁杆木虫 (著名写手)
引用回帖:
21楼: Originally posted by sobereva at 2011-10-18 13:31:52:
程序手册里有实例


“这里的各个基函数是各原子的1s，2p等等的吧？”
对于极小基可以这么认为。而对于扩展基，基函数和原子轨道（1s, 2p之类)之间没有完整的一一对应关系。

“这里面一次计算是把两个分子 ...

例子只有一个输出文件NH3BF3.out，没有相应的输入文件。

另外这个问题还是没明白怎么弄：
“这里面一次计算是把两个分子提取出来分别计算一次能量？然后怎么得到两体的HOMO组合系数？“
对，分别计算。用pop=full就会输出组合系数。

加入pop=full分别计算一次能量吗？那出现的是每个分子的组合系数呀，还是不知道怎么产生两个分子HOMO的组合系数，你那个说明书跟你的软件不一致，你的说明说是1.6版的但是你的软件列表里面没有
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嘟啦啦嘟啦啦嘟
22楼2011-10-18 14:03:31
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beefly

专家顾问 (职业作家)

地沟油冶炼专家

【答案】应助回帖

★ ★
ben_ladeng(金币+2): 专家考核存档 2011-10-17 11:48:43
贺仪(金币+5): 谢谢 2011-10-17 14:46:34
iop(3/33=2)：打印重叠矩阵，以及其他矩阵的信息
pop=full：打印全部轨道因子。
默认打印hf/dft级别的轨道能量
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beefly《西太平洋大学现代英汉词典》[bi:fli]牛肉一般地
2楼2011-10-17 11:26:14
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zhou2009

版主 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★
ben_ladeng(金币+2): 谢谢斑竹 2011-10-17 11:49:06
贺仪(金币+5): 谢谢，还是有点问题…… 2011-10-17 14:46:24
既是非专业GAUSSIAN使用者，你是问如何在输出结果中得到相应的数据吧。

加关键词：Pop=Full，得到：molecular orbital coefficients and energies

加关键词：iop(3/33=1)，得到：overlap matrix
赞一下(1人) 回复此楼
3楼2011-10-17 11:26:44
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beefly

专家顾问 (职业作家)

地沟油冶炼专家

【答案】应助回帖

★ ★
ben_ladeng: 专家考核存档 2011-10-17 11:49:17
zhou2009(金币+2): 2011-10-17 12:43:57
贺仪(金币+5): 谢谢，还是有点问题…… 2011-10-17 14:46:15
如果你问“怎么计算overlap matrix”：gaussian至少有两种算法。iop(3/38=2)用标准公式算。目前默认的prism方法很繁琐，思路是先把所有积分转化成标准的双电子积分一般公式，然后用统一的方法计算，有点画蛇添足的感觉。
赞一下(2人) 回复此楼
beefly《西太平洋大学现代英汉词典》[bi:fli]牛肉一般地
4楼2011-10-17 11:31:29
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