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jinjingnan

木虫 (小有名气)

[求助] sybyl对接问题

使用sybyl中的surflex对接数据库时，surflex一次可以接受的多大的数据库呢（最好能说个具体的数字）？从specs里下载到的数据库有几十万个的就对接不了，一直提示分子结构读入错误，还有就是哪个工具可以把大的数据库进行分割啊？谢谢！
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jjn
1楼 2011-10-14 09:20:59
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景宿

铜虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

jinjingnan(金币+5): 谢啦 2011-10-16 12:43:26
你对从spece下载下来的数据进行过处理了嘛？那个都是二维结构而且都是没有氢原子的，要进行处理之后才能对接，另外蛋白质也要进行处理之后才能进行对接的。我用过sybyl的对接，感觉速度还是挺快的。希望对你有帮助
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2楼2011-10-15 10:05:14
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jinjingnan

木虫 (小有名气)
你说的这两点我都已经做过处理啦，听说对于那些很大的数据库要进行分割，主要是想找一个这方面的分割软件，谢谢你啊!
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jjn
3楼2011-10-16 12:45:46
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