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izff2008

铜虫 (小有名气)

[求助] 蝴蝶兰组培的一个污染菌，请大家看看是什么，最好能鉴定到属？谢了

蝴蝶兰组培的一个污染菌，请大家看看是什么，最好能鉴定到属？谢了
菌的外部颜色是黄色的。
在显微镜下观察是蓝绿色的杆菌如图。请大家帮忙看看。
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izff2008

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1楼 2011-10-13 12:59:43
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雨伞

金虫 (小有名气)
★ ★
SongQ5285: 金币+2, 鼓励交流 2012-04-05 17:56:12
看图片应该为芽孢杆菌属或类芽孢杆菌属的，拿孔雀绿染芽孢看看，若为绿色就是芽孢，说明是G+菌，挑单菌落加吐温反复冻融一下，取适量直接菌液PCR16S就行了，测下序，NCBI比对一下就没问题了。
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9楼2012-02-27 21:26:16
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twisty

木虫 (正式写手)

newer

【答案】应助回帖

肉眼是无法达到楼的要求的。而且图片也不尽人意啊。
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兼并碱基M=A/CR=A/GW=A/TS=G/CY=C/TK=G/TV=A/G/C&n...
2楼2011-10-14 09:27:09
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xyzge

铜虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★
jhu132llh(金币+2): good,感谢新虫积极应助 2011-10-14 20:43:56
像黄单胞菌的外形，微生物看不出来，还是做个质粒看看吧，不行直接给菌种出钱让公司做做。
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3楼2011-10-14 15:07:30
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独立寒秋

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★
jhu132llh(金币+1): good,鼓励积极应助 2011-10-17 17:08:30
用平板划线得到单菌落（纯培养），然后摇瓶培养取菌液抽总DNA，用通用引物扩16s rDNA,用通用引物为测序引物直接测pcr产物全长，测序结果到NCBI上进行blast比对，应该能定位到属.
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4楼2011-10-16 13:05:13
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