| 查看: 1260 | 回复: 1 | ||
bs340248铜虫 (小有名气)
|
[求助]
fix rigid命令请教
|
|
请教个问题： 模拟的体系有200个相同的分子，共10000个原子（data文件里面已经在第二列将每个分子的序号从1-200分配好了）。我希望分子是刚性的（分子内的键长键角不变），所以用了 fix 1 all rigid/nvt molecule temp 300 300 100 这个命令，结果模拟的时候温度不停上升，但是用vmd查看的时候发现模拟的体系中，分子只在起始位置附近微微震动。 希望大家能给我个建议，我错在哪里了 谢谢 为了测试，我做了个只有4个分子（200个原子）的体系，这4个分子分散得很开，用相同的in文件进行模拟，结果模拟的温度不停上升，用vmd查看的时候发现这4个分子还算是符合我的预期，整体在运动 [ Last edited by bs340248 on 2011-10-12 at 13:45 ] |
回复此楼» 猜你喜欢
北科281学硕材料求调剂
已经有9人回复
-
306求0703调剂一志愿华中师范
已经有6人回复
-
276求调剂。有半年电池和半年高分子实习经历
已经有8人回复
-
接收2026硕士调剂(学硕+专硕)
已经有3人回复
-
材料与化工考研调剂
已经有3人回复
-
081700 调剂 267分
已经有3人回复
-
一志愿重庆大学085700资源与环境，总分308求调剂
已经有3人回复
-
336化工调剂
已经有4人回复
-
08工学调剂
已经有10人回复
-
263求调剂
已经有6人回复
» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)
» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
- 请教活鱼称重的问题
已经有12人回复
- 请教醇提取物的脱脂方法
已经有11人回复
- 请教一句英文的后置语？谢谢指教
已经有2人回复
- 请教大家激光方面的研究所或者大学哪些比较好呢？
已经有17人回复
- word2003每次初次打开都出现“向程序发送命令失败”,请教高手！谢谢！
已经有2人回复
- 请教origin作图问题
已经有11人回复
- 【求助】请教怎样从一块塑料板上切不同厚度的试件
已经有9人回复
- 【讨论】lammps中关于fix ave/spatial命令的输出问题
已经有4人回复
- 【求助】请教几种特殊结构的荧光染料
已经有9人回复
- 【求助】如何固定某几个原子不动？
已经有20人回复
2楼2012-02-01 05:25:15
