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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 生物科学 » 求从RNA-seq得到可变剪接的软件
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mmjjwanm

金虫 (正式写手)
引用回帖:
9楼: Originally posted by 今夜无风 at 2011-10-12 10:42:50:
这个好像只是做mapping的

Mapping是用Bowtie，MAQ之类的吧

Tophat和Bowtie我都自己用过
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11楼2011-10-12 11:30:36
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baby1885

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★
lstt09nk(金币+2): 感谢交流 2011-10-13 10:38:25
引用回帖:
7楼: Originally posted by 今夜无风 at 2011-10-12 10:40:36:
这个现在正在看，不过因为没有参考文献，不好确定他的准确性，想看看有没有更权威的

这个还在审稿，准确性大可放心，它是根据现有的6种剪切模型来确定可变剪切
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没有最好，只有更好!
12楼2011-10-13 09:02:09
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今夜无风

铜虫 (小有名气)
引用回帖:
12楼: Originally posted by baby1885 at 2011-10-13 09:02:09:
这个还在审稿，准确性大可放心，它是根据现有的6种剪切模型来确定可变剪切

你是论文的作者之一么？想问一下，相关的算法是自己做的还是整合别人的？
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13楼2011-10-17 10:35:10
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137167741

至尊木虫 (著名写手)
http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=3861921
http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=3857538
看看这个。
赞一下(1人) 回复此楼
总有一天我要修改用户名。
14楼2012-02-24 16:29:49
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jiyangz

新虫 (初入文坛)
我从cufflinks软件分析得到了大量结果，但是结果只是标注了位置，我想再找回基因原本的fastq格式文件。。。。。。我该怎么找回？？急求！

如何快速的把基因的大量的物理位置转换为fastq格式文件，用什么软件或脚本？？？
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15楼2014-07-30 10:38:08
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