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今夜无风

铜虫 (小有名气)

[求助] 求从RNA-seq得到可变剪接的软件

请问大侠有没有什么好的工具能够从RNA-seq数据得到可变剪接数据的??

[ Last edited by 今夜无风 on 2011-10-10 at 10:36 ]
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baby1885

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★
lstt09nk(金币+2): 感谢交流 2011-10-13 10:38:25
引用回帖:
7楼: Originally posted by 今夜无风 at 2011-10-12 10:40:36:
这个现在正在看,不过因为没有参考文献,不好确定他的准确性,想看看有没有更权威的

这个还在审稿,准确性大可放心,它是根据现有的6种剪切模型来确定可变剪切
没有最好,只有更好!
12楼2011-10-13 09:02:09
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查看全部 15 个回答

今夜无风

铜虫 (小有名气)

怎么没人回复呢?大家都没有做这一块的么?
2楼2011-10-10 10:42:01
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baby1885

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★
lstt09nk(金币+2): 感谢参与 2011-10-11 14:21:46
没有最好,只有更好!
3楼2011-10-11 10:16:49
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yisn

铁杆木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★
lstt09nk(金币+2): 鼓励参与 2011-10-11 14:22:02
TOPHAT cufflinks 跟splicing好像有关系。不过我不做这个。你可以去这些个软件的网站看看,跟bowtie之类的是同一个组开发的。在nature子刊上发表过的软件。
慢工出细活...
4楼2011-10-11 10:48:38
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