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wendy808

新虫 (初入文坛)

[交流] 求助引物设计方法,请高手帮忙指点迷津。。。万分感谢 已有3人参与

情况是这样的,我做的实验是克隆细菌的某个基因,但我的菌只鉴定到了属,没有鉴定到种,而这个基因在同一个属的不同种的序列差别很大,所以无法根据同源性来设计引物,这样的话我就实在想不出用什么办法可以设计引物了,请各位帮忙指点一下吧。
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snoopyzxx

木虫 (著名写手)

★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖
amisking(金币+1): 鼓励发帖交流! 2011-10-08 19:33:55
不同种之间总有一段同源性比较高的吧?根据这段就可以设计引物了啊。
或者可以设计简并引物。你这种情况貌似有固定方法的,你查查PCR试验指南吧。
VX:19192310212;公众号:生物技术与IVD
2楼2011-10-08 18:32:40
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doublehelix

木虫 (著名写手)

★
西瓜(金币+1): good 2011-10-09 22:09:13
根据保守区设计简并引物,PCR, 扩增,测序,然后再设计引物,通过反向PCR方法获得你的基因。
3楼2011-10-09 13:39:21
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dongjikiko

新虫 (初入文坛)

★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖
要不你考虑一下鉴定一下种吧?也为你们实验室做点贡献,呵呵,不过可能会很麻烦。。
有些错过了就是错过了,虽然遗憾,但是再也追不回来了,唉。
4楼2011-10-10 17:09:48
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wendy808

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
4楼: Originally posted by dongjikiko at 2011-10-10 17:09:48:
要不你考虑一下鉴定一下种吧?也为你们实验室做点贡献,呵呵,不过可能会很麻烦。。

嗯,目前我所想到的办法只有用生理生化实验来鉴定种了。的确是相当麻烦了。
5楼2011-10-10 22:53:24
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