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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 量子化学 » Gaussian » 有关O=S=O的OPT优化
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scottfreedom

金虫 (正式写手)

[求助] 有关O=S=O的OPT优化

在进行O=S=O优化时，S=O的输出结果（LOG文件）居然显示是单键，请高手指教，用的方法是Hartree-Fock，基组：3-21G，一并附上LOG和GJF文件
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Terse
1楼2011-09-30 18:13:35
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chiweijie

禁虫 (著名写手)
★ ★
gmy1990(金币+2): 2011-09-30 20:35:21
scottfreedom(金币+3): 3 2011-09-30 21:25:30
本帖内容被屏蔽
2楼2011-09-30 20:25:44
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scottfreedom

金虫 (正式写手)
引用回帖:
1楼: Originally posted by scottfreedom at 2011-09-30 18:13:35:
在进行O=S=O优化时，S=O的输出结果（LOG文件）居然显示是单键，请高手指教，用的方法是Hartree-Fock，基组：3-21G，一并附上LOG和GJF文件

键长是在1.5左右，附件里面有，我就比较担心这一点
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Terse
3楼2011-09-30 21:26:00
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dreamyeye

木虫 (著名写手)
★ ★
zhou2009(金币+2): 是的 2011-10-01 20:09:58
引用回帖:
3楼: Originally posted by scottfreedom at 2011-09-30 21:26:00:
键长是在1.5左右，附件里面有，我就比较担心这一点

觉得应该就是单键，因为硫原子已经形成四面体构型，不可能形成双键。
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4楼2011-10-01 19:32:26
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scottfreedom

金虫 (正式写手)
引用回帖:
4楼: Originally posted by dreamyeye at 2011-10-01 19:32:26:
觉得应该就是单键，因为硫原子已经形成四面体构型，不可能形成双键。

但是在TS里面，S与氧的连接就是双键，所以想请教啊
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Terse
5楼2011-10-02 00:12:20
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dreamyeye

木虫 (著名写手)
★ ★ ★
小红豆(金币+3): 谢谢 2011-10-02 14:33:26
引用回帖:
5楼: Originally posted by scottfreedom at 2011-10-02 00:12:20:
但是在TS里面，S与氧的连接就是双键，所以想请教啊

ts是什么样，我觉得是不是两个硫氧双键断了分别与氮和碳成键了？另外，ts里你也可以看一下，硫氧键的长度估计也别so2里的要长，gaussview里给出的的键级应该不是绝对的，而是根据键长做出的一个判断。
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6楼2011-10-02 08:58:39
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scottfreedom

金虫 (正式写手)
引用回帖:
6楼: Originally posted by dreamyeye at 2011-10-02 08:58:39:
ts是什么样，我觉得是不是两个硫氧双键断了分别与氮和碳成键了？另外，ts里你也可以看一下，硫氧键的长度估计也别so2里的要长，gaussview里给出的的键级应该不是绝对的，而是根据键长做出的一个判断。

TS是对甲基苯磺酰，我估计这是gauss里面的问题，但是，我在构造分子的时候，gauss的fragment里面就有s用双键分别连接两个氧，另外带两个单键，看来还不是很好理解......郁闷，我就担心分子构型出来是错误的
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Terse
7楼2011-10-02 09:20:58
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wangth0921

铁虫 (职业作家)
★
zhou2009(金币+1): 2011-10-04 08:50:20
涉及硫原子的计算通常要再基组中加入d轨道。你这里用HF/3-21G，其结果很值得怀疑。
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8楼2011-10-04 00:53:16
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dreamyeye

木虫 (著名写手)
★
zhou2009(金币+1): 2011-10-04 08:51:03
引用回帖:
7楼: Originally posted by scottfreedom at 2011-10-02 09:20:58:
TS是对甲基苯磺酰，我估计这是gauss里面的问题，但是，我在构造分子的时候，gauss的fragment里面就有s用双键分别连接两个氧，另外带两个单键，看来还不是很好理解......郁闷，我就担心分子构型出来是错误的

你说的gauss是gaussview吧，gaussview里的键级对gaussian的计算结果是没有任何影响的，你完全不看他都可以，所以不要再纠结用gaussview构造的几键几键了，那些信息应该不会带入gaussian的。
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9楼2011-10-04 01:25:07
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dreamyeye

木虫 (著名写手)
引用回帖:
8楼: Originally posted by wangth0921 at 2011-10-04 00:53:16:
涉及硫原子的计算通常要再基组中加入d轨道。你这里用HF/3-21G，其结果很值得怀疑。

使用HF方法的准确性现在来看应该也是不够的。
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10楼2011-10-04 01:25:44
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