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[求助]
用discover模块做吸附时
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| 吸附质和吸附表面的大小怎么样确定，就是怎样设定二的大小使其匹配，还有要在水溶液当中进行吸附模拟的话怎样加水盒子，，，急啊！！！求知道的大侠指点啊！！！ |
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3楼2016-10-18 08:15:31
【答案】应助回帖
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uuv2010(金币+3): 多谢提示 2011-10-05 16:59:08
uuv2010(金币+3): 多谢提示 2011-10-05 16:59:08
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我也是刚刚开始接触MD，大家互相学习，关于你提出的问题，我说一下自己的见解，首先你应该确定你吸附表面的大小，不知道你的吸附材料是什么，我用的是Fe，首先就是切面，超晶胞（这一步确定你的吸附表面的大小，你可以用build-symmetry-Lattice parameters查看，其中a和b的数值就是你表面的大小）。 而吸附质与吸附表面的大小匹配要借助水盒子来完成，你要用Modules-AmorphousCell-Construction来建立一个含有若干水分子和吸附质的盒子，然后在对话框中找到Cell parameters（Angstrom）选择Specify a，b，改变a，b的数值使之与之前的吸附表面的a，b的数值相匹配。 |
2楼2011-10-04 16:07:44