应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » Siesta&Smeagol&Atk » 有人用SIESTA跑过分子动力学模拟吗？
31/1返回列表
查看: 1354  |  回复: 3
查看全部回帖 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看
当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖

zhangguangping

木虫 (著名写手)

[交流] 有人用SIESTA跑过分子动力学模拟吗？

想和大家交流一下怎么使用SIESTA跑分子动力学。
(1)一般能跑多大的体系？
(2)跑完了之后，能得到各种结构的几率分布吗？我记得Amber中可以得到出现几率最大的结构。看手册，好像不能得到结构分布几率。只能得到最后的一个结构。
(3)SIESTA跑出来的结果和别的软件，如Amber等得到的结果相差多大，就是说SIESTA跑出来的结果可信度有多少？
希望使用SIESTA的高手交流一下。
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:

» 抢金币啦！回帖就可以得到:

查看全部散金贴
1楼 2011-09-26 08:37:40
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

zhangguangping

木虫 (著名写手)
引用回帖:
2楼: Originally posted by minmin_0082003 at 2011-10-05 09:42:29:
实验室助教跑过，因为基组的原因，效率不是很高。答非所问了呵呵

谢谢。效率还是可以的。我觉得。因为我没用过其他的力场动力学的方法。所以感觉不出来这个速度。如果用力场跑动力学的话，可能快很多。
赞一下 回复此楼
3楼2011-10-05 09:49:13
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 zhangguangping 的主题更新
31/1返回列表
普通表情 龙 兔 虎 猫 高级回复 (可上传附件)
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭