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dummy1木虫 (正式写手)
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[求助]
discover跑有机晶体的MD，分子散掉的问题
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大家好，我在用discover模块进行有机晶体模拟的时候，跑一段时间分子就乱七八糟的了是怎么回事啊？比如说我从晶体库取出来的晶体，建立超包（超包设成P1点群，单包对称性比较高）后从一个方向上所有的pi共轭分子都是平行的，但是我在MD一段时间后所有的分子都错位了，变的杂乱无章，在具体作的时候non-bond中vdw和库仑都是用的ewald方法，用的力场是compass力场（好像别的力场也存在同样的问题。。。）。哪位高手帮帮忙阿。搞了好久了也没有弄明白。 [ Last edited by dummy1 on 2011-9-20 at 10:58 ] |
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